Активатор апоптоза harakiri

Активатор апоптоза harakiri
Активатор апоптоза harakiri
Доступные структуры
Доступные структуры
PDB	Поиск по базе UniProt: PDBe RCSB
Список идентификаторов PDB
Список идентификаторов PDB
	2L58, 2L5B
Идентификаторы
Псевдонимы	HRK, DP5, HARAKIRI, harakiri, BCL2 interacting protein
Внешние ID	OMIM: 603447 HomoloGene: 136405 GeneCards: HRK
Расположение гена (человек)
Расположение гена (человек)
Хр.	12-я хромосома человека
Конец	116,881,441 bp
Паттерн экспрессии РНК
Паттерн экспрессии РНК
	Наибольшая экспрессия в
	pancreatic ductal cell; ; Цитоархитектоническое поле Бродмана 23; ; hippocampus proper; ; middle temporal gyrus;
	н/д
	Дополнительные справочные данные
	; ;
	Дополнительные справочные данные
Генная онтология
Генная онтология
Молекулярная функция	связывание с белками плазмы;
Компонент клетки	часть мембраны; мембрана; митохондрия;
Биологический процесс	regulation of apoptotic process; positive regulation of protein homooligomerization; positive regulation of release of cytochrome c from mitochondria; positive regulation of apoptotic process; апоптоз;
	Источники: Amigo, QuickGO
Ортологи
Ортологи
	8739
	н/д
	ENSG00000135116
	н/д
	O00198
	н/д
	NM_003806
	н/д
	NP_003797
	н/д
	Информация в Викиданных
Смотреть (человек)

Активатор апоптоза harakiri (HRK) — белок семейства Bcl2, активатор апоптоза, который у человека кодируется геном HRK.

Структура гена, мРНК и белкаПравить

кДНК HRK была впервые независимо клонирована из клеток HeLa и симпатических нейронов крыс в 1997 году^[3]^[4]. кДНК HRK человека имела длину около 700 нуклеотидов и включала 5'- и 3'-некодирующие области, кодирующую область и поли(А)-хвост. В 3'-некодирующей области был обнаружен сигнал дестабилизации мРНК 5'-ATTTA-3'^[3].

Ген HRK кодирует белок длиной в 91 аминокислотный остаток. Гомологи HRK по первичной структуре пока не обнаружены. Фрагмент 37—44 гомологичен домену BH3 (англ. Bcl-2 homology domain 3)^[3].

Распространение и внутриклеточная локализацияПравить

Методом нозерн-блота мРНК HRK была обнаружена в лимфоидных органах, особенно в селезёнке и костном мозге, а также в поджелудочной железе человека^[3]. Хотя методом полногеномного секвенирования РНК присутствие мРНК HRK в селезёнке и костном мозге выявить не удалось, небольшие её количества были обнаружены в лимфатических узлах, коре головного мозга, щитовидной железе, надпочечниках и тестикулах^[5].

мРНК HRK была обнаружена только в головном мозге взрослых крыс и отсутствовала в селезёнке, тимусе, тестикулах, тонком кишечнике, сердечной и скелетных мышцах^[4].

Методом иммуногистохимии низкие и средние количества белка Hrk были обнаружены во многих органах, при этом препараты тонкого кишечника, поджелудочной железы, кожи, молочных желёз и лимфоидных тканей имели, как правило, отрицательную окраску (белок отсутствует)^[5].

В клетках HRK локализуется преимущественно в митохондриях и взаимодействует там с белком митохондриального матрикса p32^[6].

ПримечанияПравить

↑ ¹ ² ³ GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000135116 - Ensembl, May 2017
↑ Ссылка на публикацию человека на PubMed: (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
↑ ¹ ² ³ ⁴ Inohara N., Ding L., Chen S., Núñez G. harakiri, a novel regulator of cell death, encodes a protein that activates apoptosis and interacts selectively with survival-promoting proteins Bcl-2 and Bcl-X(L) // EMBO J. — 1997. — Vol. 16, № 7. — P. 1686—94. — PMID 9130713.
↑ ¹ ² Imaizumi K., Tsuda M., Imai Y., Wanaka A., Takagi T., Tohyama M. Molecular cloning of a novel polypeptide, DP5, induced during programmed neuronal death // J Biol Chem. — 1997. — Vol. 272, № 30. — P. 18842—8. — PMID 9228060.
↑ ¹ ² HRK в базе данных The Human Protein Atlas (неопр.). Дата обращения: 7 апреля 2014. Архивировано 9 апреля 2014 года.
↑ Sunayama J., Ando Y., Itoh N., Tomiyama A., Sakurada K., Sugiyama A., Kang D., Tashiro F., Gotoh Y., Kuchino Y., Kitanaka C. Physical and functional interaction between BH3-only protein Hrk and mitochondrial pore-forming protein p32 // Cell Death Differ. — 2004. — Vol. 11, № 7. — P. 771—81. — PMID 15031724.

[refGRCh38Ensembl-1] ¹ ² ³ GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000135116 - Ensembl, May 2017

[2] Ссылка на публикацию человека на PubMed: (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[Inohara1997-3] ¹ ² ³ ⁴ Inohara N., Ding L., Chen S., Núñez G. harakiri, a novel regulator of cell death, encodes a protein that activates apoptosis and interacts selectively with survival-promoting proteins Bcl-2 and Bcl-X(L) // EMBO J. — 1997. — Vol. 16, № 7. — P. 1686—94. — PMID 9130713.

[Imaizumi1997-4] ¹ ² Imaizumi K., Tsuda M., Imai Y., Wanaka A., Takagi T., Tohyama M. Molecular cloning of a novel polypeptide, DP5, induced during programmed neuronal death // J Biol Chem. — 1997. — Vol. 272, № 30. — P. 18842—8. — PMID 9228060.

[HPA-5] ¹ ² HRK в базе данных The Human Protein Atlas (неопр.). Дата обращения: 7 апреля 2014. Архивировано 9 апреля 2014 года.

[Sunayama2004-6] Sunayama J., Ando Y., Itoh N., Tomiyama A., Sakurada K., Sugiyama A., Kang D., Tashiro F., Gotoh Y., Kuchino Y., Kitanaka C. Physical and functional interaction between BH3-only protein Hrk and mitochondrial pore-forming protein p32 // Cell Death Differ. — 2004. — Vol. 11, № 7. — P. 771—81. — PMID 15031724.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]