RasMol

RasMol
RasMol
Тип	Биоинформатика
Разработчик	Herbert J. Bernstein
Написана на	C
Операционная система	Microsoft Windows, Linux, Apple Macintosh
Языки интерфейса	Английский, Русский
Первый выпуск	1992
Последняя версия	2.7.5 (3 June 2009 (rev. 23 July 2009))
Репозиторий	sourceforge.net/p/openra…
Читаемые форматы файлов	Protein Data Bank[d]
Лицензия	GNU General Public License
Сайт	rasmol.org
	Медиафайлы на Викискладе

RasMol — компьютерная программа, предназначенная для визуализации молекул и используемая преимущественно для изучения и получения изображений пространственных структур биологических макромолекул, в первую очередь белков и нуклеиновых кислот. Первая версия программы RasMol была создана Роджером Сэйлом в начале 90-х годов.

Отображение в RasMol тримера белка TRAF2. Код PDB 1DOA

Начиная с версий серии 2.7, RasMol распространяется по двойной лицензии (GPL или RASLIC). Тем самым, RasMol (наряду с Jmol и PyMOL) — одна из немногих программ визуализации молекул с открытым кодом.

Исходными данными для визуализации служат координаты атомов молекулы (или комплекса молекул), содержащиеся в файле формата Protein Data Bank (PDB). Файлы с координатами атомов могут быть скопированы с одного из сайтов PDB (см. Worldwide Protein Data Bank).

RasMol продолжает активно использоваться молекулярными биологами и биоинформатиками. Благодаря простой и логичной структуре пользовательского интерфейса, программа проста для освоения. Система команд, разработанная для программы ("язык" RasMol'а) используется в других программах, например, в Jmol. Последняя постепенно вытесняет RasMol, поскольку почти столь же проста в освоении, охватывает всю функциональность RasMol и обладает некоторыми дополнительными возможностями.

СсылкиПравить

Официальный сайт