NLRC4

NLRC4
NLRC4
Обозначения
Символы	NLRC4; CLAN, CLAN1, CLANA, CLANB, CLANC, CLAND, CLR2.1, ipaf, CARD12
Entrez Gene	58484
HGNC	16412
OMIM	606831
RefSeq	NM_001199138
UniProt	Q9NPP4
Другие данные
Локус	2-я хр., 2p22 p21
	Информация в Викиданных ?

NLRC4 (англ. NLR family, CARD domain containing 4) — цитозольный белок, Nod-подобный рецептор из подсемейства NOD, продукт гена NLRC4. Ген клонирован в 2001 году. ^[1] Играет роль в активации апоптоза.

ФункцииПравить

Играет роль в активации каспазы-1 в ответ на бактериальные патогены (липополисахарид, флагеллин, PrgJ).

СтруктураПравить

Зрелый белок состоит из 1024 аминокислот, молекулярная масса — 116,2 кДа. Молекула включает CARD-домен, NACHT-домен с участком связывания АТФ и 14 LRR (лейцин-обогащённых)-повторов.

В результате альтернативного сплайсинга образуются 4 изоформы.

Взаимодействует через CARD-домены с ASC, NOD2, BCL10, NALP1, каспазой-1 и CARD15. ^[2]

ПримечанияПравить

↑ Damiano J.S., Stehlik C., Pio F., Godzik A., Reed J.C. CLAN, a novel human CED-4-like gene (неопр.) // Genomics. — Academic Press, 2001. — July (т. 75, № 1—3). — С. 77—83. — doi:10.1006/geno.2001.6579. — PMID 11472070.
↑ UniProt Q9NPP4 (неопр.). Дата обращения: 15 мая 2012. Архивировано 6 ноября 2012 года.

ЛитератураПравить

Kofoed E.M., Vance R.E. Innate immune recognition of bacterial ligands by NAIPs determines inflammasome specificity (англ.) // Nature : journal. — 2011. — September (vol. 477, no. 7366). — P. 592—595. — doi:10.1038/nature10394. — PMID 21874021. — PMC 3184209.
Poyet J.L., Srinivasula S.M., Tnani M., et al. Identification of Ipaf, a human caspase-1-activating protein related to Apaf-1. (англ.) // Journal of Biological Chemistry : journal. — 2001. — Vol. 276, no. 30. — P. 28309—28313. — doi:10.1074/jbc.C100250200. — PMID 11390368.
Damiano J.S., Stehlik C., Pio F., et al. CLAN, a novel human CED-4-like gene. (неопр.) // Genomics. — Academic Press, 2001. — Т. 75, № 1—3. — С. 77—83. — doi:10.1006/geno.2001.6579. — PMID 11472070.
Strausberg R.L., Feingold E.A., Grouse L.H., et al. Generation and initial analysis of more than 15,000 full-length human and mouse cDNA sequences. (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 2003. — Vol. 99, no. 26. — P. 16899—16903. — doi:10.1073/pnas.242603899. — PMID 12477932. — PMC 139241.
Fu W.N., Bertoni F., Kelsey S.M., et al. Role of DNA methylation in the suppression of Apaf-1 protein in human leukaemia. (англ.) // Oncogene (англ.) (рус. : journal. — 2003. — Vol. 22, no. 3. — P. 451—455. — doi:10.1038/sj.onc.1206147. — PMID 12545166.
Clark H.F., Gurney A.L., Abaya E., et al. The secreted protein discovery initiative (SPDI), a large-scale effort to identify novel human secreted and transmembrane proteins: a bioinformatics assessment. (англ.) // Genome Research (англ.) (рус. : journal. — 2003. — Vol. 13, no. 10. — P. 2265—2270. — doi:10.1101/gr.1293003. — PMID 12975309. — PMC 403697.
Ota T., Suzuki Y., Nishikawa T., et al. Complete sequencing and characterization of 21,243 full-length human cDNAs. (англ.) // Nature Genetics : journal. — 2004. — Vol. 36, no. 1. — P. 40—5. — doi:10.1038/ng1285. — PMID 14702039.
Agostini L., Martinon F., Burns K., et al. NALP3 forms an IL-1beta-processing inflammasome with increased activity in Muckle-Wells autoinflammatory disorder. (англ.) // Immunity : journal. — Cell Press, 2004. — Vol. 20, no. 3. — P. 319—325. — doi:10.1016/S1074-7613(04)00046-9. — PMID 15030775.
Damiano J.S., Oliveira V., Welsh K., Reed J.C. Heterotypic interactions among NACHT domains: implications for regulation of innate immune responses. (англ.) // Biochemical Journal (англ.) (рус. : journal. — 2004. — Vol. 381, no. Pt 1. — P. 213—219. — doi:10.1042/BJ20031506. — PMID 15107016. — PMC 1133779.
Gerhard D.S., Wagner L., Feingold E.A., et al. The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). (англ.) // Genome Research (англ.) (рус. : journal. — 2004. — Vol. 14, no. 10B. — P. 2121—2127. — doi:10.1101/gr.2596504. — PMID 15489334. — PMC 528928.
Damiano J.S., Newman R.M., Reed J.C. Multiple roles of CLAN (caspase-associated recruitment domain, leucine-rich repeat, and NAIP CIIA HET-E, and TP1-containing protein) in the mammalian innate immune response. (англ.) // Journal of Immunology (англ.) (рус. : journal. — 2004. — Vol. 173, no. 10. — P. 6338—6345. — PMID 15528373.
Sadasivam S., Gupta S., Radha V., et al. Caspase-1 activator Ipaf is a p53-inducible gene involved in apoptosis. (англ.) // Oncogene (англ.) (рус. : journal. — 2005. — Vol. 24, no. 4. — P. 627—636. — doi:10.1038/sj.onc.1208201. — PMID 15580302.
Lu C., Wang A., Wang L., et al. Nucleotide binding to CARD12 and its role in CARD12-mediated caspase-1 activation. (англ.) // Biochemical and Biophysical Research Communications (англ.) (рус. : journal. — 2005. — Vol. 331, no. 4. — P. 1114—1119. — doi:10.1016/j.bbrc.2005.04.027. — PMID 15882992.
Rual J.F., Venkatesan K., Hao T., et al. Towards a proteome-scale map of the human protein-protein interaction network. (англ.) // Nature : journal. — 2005. — Vol. 437, no. 7062. — P. 1173—1178. — doi:10.1038/nature04209. — PMID 16189514.
Thalappilly S., Sadasivam S., Radha V., Swarup G. Involvement of caspase 1 and its activator Ipaf upstream of mitochondrial events in apoptosis. (англ.) // FEBS Journal (англ.) (рус. : journal. — 2006. — Vol. 273, no. 12. — P. 2766—2778. — doi:10.1111/j.1742-4658.2006.05293.x. — PMID 16817903.

[1] Damiano J.S., Stehlik C., Pio F., Godzik A., Reed J.C. CLAN, a novel human CED-4-like gene (неопр.) // Genomics. — Academic Press, 2001. — July (т. 75, № 1—3). — С. 77—83. — doi:10.1006/geno.2001.6579. — PMID 11472070.

[2] UniProt Q9NPP4 (неопр.). Дата обращения: 15 мая 2012. Архивировано 6 ноября 2012 года.

[1]

[2]