CLDN18

CLDN18
CLDN18
Идентификаторы
Псевдонимы	CLDN18, SFTA5, SFTPJ, claudin 18
Внешние ID	OMIM: 609210 MGI: 1929209 HomoloGene: 9489 GeneCards: CLDN18
Расположение гена (человек)
Расположение гена (человек)
Хр.	3-я хромосома человека
Конец	138,033,655 bp
Расположение гена (Мышь)
Расположение гена (Мышь)
Хр.	9-я хромосома мыши
Конец	99,599,320 bp
Паттерн экспрессии РНК
Паттерн экспрессии РНК
	Наибольшая экспрессия в
	lower lobe of lung; ; upper lobe of lung; ; upper lobe of left lung; ; body of stomach; ; visceral pleura; ; fundus;
	Наибольшая экспрессия в
	mucous cell of stomach; ; right lung lobe; ; Epithelium of stomach; ; pyloric antrum; ; left lung lobe; ; proximal tubule; ; sexually immature organism;
	Дополнительные справочные данные
	; ; ; ;
	Дополнительные справочные данные
Генная онтология
Генная онтология
Молекулярная функция	structural molecule activity; связывание похожих белков;
Компонент клетки	часть мембраны; Межклеточные контакты; клеточная мембрана; мембрана; bicellular tight junction;
Биологический процесс	negative regulation of protein localization to nucleus; TNFSF11-mediated signaling pathway; calcium-independent cell-cell adhesion via plasma membrane cell-adhesion molecules; digestive tract development; negative regulation of osteoclast development; negative regulation of bone resorption; response to ethanol;
	Источники: Amigo, QuickGO
Ортологи
Ортологи
	51208
	56492
	ENSG00000066405
	ENSMUSG00000032473
	P56856
	P56857
	NM_016369; NM_001002026
	NM_001194921; NM_001194922; NM_001194923; NM_019815
	NP_001002026; NP_057453
	NP_001181850; NP_001181851; NP_001181852; NP_062789
	Информация в Викиданных
Смотреть (человек)	Смотреть (мышь)

Клаудин 18 (англ. Claudin-18) — мембранный белок семейства клаудинов, продукт гена CLDN18.

ФункцииПравить

Клаудины участвуют в образовании плотных контактов между эпителиальными клетками.^[5]^[6], занимая наиболее апикальную позицию. CLDN18 экспрессируется на эпителиальных клетках лёгких и желудка. Альтернативный сплайсинг приводит к образованию двух изоформ. Изоформа 1 экспрессирована на пневмоцитах (главным образом типа I), а изоформа 2 — в эпителии желудка.

Клиническое значениеПравить

Изоформа 2 (Клаудин 18.2) сильно экспрессируется клетками рака желудка^[7]. Антитела к клаудину 18.2 (IMAB362, или Zolbetuximab) исследуются как потенциальное терапевтическое средство при раке желудка.^[7]

ПримечанияПравить

↑ ¹ ² ³ GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000066405 - Ensembl, May 2017
↑ ¹ ² ³ GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000032473 - Ensembl, May 2017
↑ Ссылка на публикацию человека на PubMed: (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
↑ Ссылка на публикацию мыши на PubMed: (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
↑ Niimi T., Nagashima K., Ward J.M. et al. claudin-18, a Novel Downstream Target Gene for the T/EBP/NKX2.1 Homeodomain Transcription Factor, Encodes Lung- and Stomach-Specific Isoforms through Alternative Splicing (англ.) // Mol. Cell. Biol. (англ.) (рус. : journal. — 2001. — Vol. 21, no. 21. — P. 7380—7390. — doi:10.1128/MCB.21.21.7380-7390.2001. — PMID 11585919. — PMC 99911.
↑ Entrez Gene: CLDN18 claudin 18 (неопр.). Архивировано 5 декабря 2010 года.
↑ ¹ ² Antibody Shines in Advanced Gastric Cancer - IMAB362 leads to longer remission, better survival. June 2016 (неопр.). Дата обращения: 2 ноября 2018. Архивировано 3 апреля 2018 года.

ЛитератураПравить

Kniesel U., Wolburg H. Tight junctions of the blood–brain barrier. (неопр.) // Cell. Mol. Neurobiol. (англ.) (рус.. — Springer, 2000. — Т. 20, № 1. — С. 57—76. — doi:10.1023/A:1006995910836. — PMID 10690502.
Heiskala M., Peterson P.A., Yang Y. The roles of claudin superfamily proteins in paracellular transport. (англ.) // Traffic : journal. — 2001. — Vol. 2, no. 2. — P. 93—8. — doi:10.1034/j.1600-0854.2001.020203.x. — PMID 11247307.
Tsukita S., Furuse M., Itoh M. Multifunctional strands in tight junctions. (англ.) // Nat. Rev. Mol. Cell Biol. : journal. — 2001. — Vol. 2, no. 4. — P. 285—293. — doi:10.1038/35067088. — PMID 11283726.
Tsukita S., Furuse M. Claudin-based barrier in simple and stratified cellular sheets. (англ.) // Curr. Opin. Cell Biol. (англ.) (рус. : journal. — Elsevier, 2003. — Vol. 14, no. 5. — P. 531—536. — doi:10.1016/S0955-0674(02)00362-9. — PMID 12231346.
González-Mariscal L., Betanzos A., Nava P., Jaramillo B.E. Tight junction proteins. (неопр.) // Prog. Biophys. Mol. Biol.. — 2003. — Т. 81, № 1. — С. 1—44. — doi:10.1016/S0079-6107(02)00037-8. — PMID 12475568.
Strausberg R.L., Feingold E.A., Grouse L.H. et al. Generation and initial analysis of more than 15,000 full-length human and mouse cDNA sequences (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 2003. — Vol. 99, no. 26. — P. 16899—16903. — doi:10.1073/pnas.242603899. — PMID 12477932. — PMC 139241.
Clark H.F., Gurney A.L., Abaya E. et al. The Secreted Protein Discovery Initiative (SPDI), a Large-Scale Effort to Identify Novel Human Secreted and Transmembrane Proteins: A Bioinformatics Assessment (англ.) // Genome Res. (англ.) (рус. : journal. — 2003. — Vol. 13, no. 10. — P. 2265—2270. — doi:10.1101/gr.1293003. — PMID 12975309. — PMC 403697.
Oh J.H., Yang J.O., Hahn Y. et al. Transcriptome analysis of human gastric cancer (англ.) // Mamm. Genome (англ.) (рус. : journal. — 2006. — Vol. 16, no. 12. — P. 942—954. — doi:10.1007/s00335-005-0075-2. — PMID 16341674.
Matsuda Y., Semba S., Ueda J. et al. Gastric and intestinal claudin expression at the invasive front of gastric carcinoma (англ.) // Cancer Sci. (англ.) (рус. : journal. — 2007. — Vol. 98, no. 7. — P. 1014—1019. — doi:10.1111/j.1349-7006.2007.00490.x. — PMID 17459057.
Liu F., Koval M., Ranganathan S., Fanayan S., Hancock W.S., Lundberg E.K., Beavis R.C., Lane L., Duek P., McQuade L., Kelleher N.L., Baker M.S. A systems proteomics view of the endogenous human claudin protein family (англ.) // J Proteome Res (англ.) (рус. : journal. — 2015. — doi:10.1021/acs.jproteome.5b00769. — PMID 26680015.

[refGRCh38Ensembl-1] ¹ ² ³ GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000066405 - Ensembl, May 2017

[refGRCm38Ensembl-2] ¹ ² ³ GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000032473 - Ensembl, May 2017

[3] Ссылка на публикацию человека на PubMed: (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[4] Ссылка на публикацию мыши на PubMed: (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[Niimi2001-5] Niimi T., Nagashima K., Ward J.M. et al. claudin-18, a Novel Downstream Target Gene for the T/EBP/NKX2.1 Homeodomain Transcription Factor, Encodes Lung- and Stomach-Specific Isoforms through Alternative Splicing (англ.) // Mol. Cell. Biol. (англ.) (рус. : journal. — 2001. — Vol. 21, no. 21. — P. 7380—7390. — doi:10.1128/MCB.21.21.7380-7390.2001. — PMID 11585919. — PMC 99911.

[entrez-6] Entrez Gene: CLDN18 claudin 18 (неопр.). Архивировано 5 декабря 2010 года.

[FAST-2016-7] ¹ ² Antibody Shines in Advanced Gastric Cancer - IMAB362 leads to longer remission, better survival. June 2016 (неопр.). Дата обращения: 2 ноября 2018. Архивировано 3 апреля 2018 года.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]