Щелочная фосфатаза, плацентарная

Щелочная фосфатаза, плацентарная
Щелочная фосфатаза, плацентарная
Доступные структуры
Доступные структуры
PDB	Поиск ортологов: PDBe RCSB
Список идентификаторов PDB
Список идентификаторов PDB
	1EW2, 1ZEB, 1ZED, 1ZEF, 2GLQ, 3MK0, 3MK1, 3MK2
Идентификаторы
Псевдонимы	ALPP, ALP, PALP, PLAP, PLAP-1, alkaline phosphatase, placental, ALPI, IAP
Внешние ID	OMIM: 171800 MGI: 1924018 HomoloGene: 122414 GeneCards: ALPP
Расположение гена (человек)
Расположение гена (человек)
Хр.	2-я хромосома человека
Конец	232,382,889 bp
Расположение гена (Мышь)
Расположение гена (Мышь)
Хр.	1-я хромосома мыши
Конец	87,029,328 bp
Паттерн экспрессии РНК
Паттерн экспрессии РНК
	Наибольшая экспрессия в
	right uterine tube; ; upper lobe of left lung; ; lower lobe of lung; ; left uterine tube;
	Наибольшая экспрессия в
	sexually immature organism; ; medial ganglionic eminence;
	Дополнительные справочные данные
	; ; ; ;
	Дополнительные справочные данные
Генная онтология
Генная онтология
Молекулярная функция	alkaline phosphatase activity; phosphatase activity; zinc ion binding; связывание с белками плазмы; гидролазная активность; активность катализатора; magnesium ion binding; связывание с ионом металла;
Компонент клетки	часть мембраны; anchored component of membrane; поверхность клетки; мембрана; клеточная мембрана;
Биологический процесс	метаболизм; дефосфорилирование;
	Источники: Amigo, QuickGO
Ортологи
Ортологи
	250
	76768
	ENSG00000163283
	ENSMUSG00000079440
	P05187
	F8VPQ6
	NM_001632
	NM_001081082
	NP_001623
	NP_001074551
	Информация в Викиданных
Смотреть (человек)	Смотреть (мышь)

Щелочная фосфатаза, плацентарный тип, также известный как плацентарная щелочная фосфатаза (PLAP), является аллостерическим ферментом, который у людей кодируется геном ALPP^[5]^[6]^[7], расположенным у людей на коротком плече 2-й хромосомы^[8]. Длина полипептидной цепи белка составляет 535 аминокислот, а молекулярная масса — 57 954^[9].

Кодируемый геном белок по функции относится к гидролаз. Задействован в таком биологическом процессе как полиморфизм. Белок имеет сайт связывания с ионами металлов, ионом цинка, ионом магния. Локализован в клеточной мембране.

ГенПравить

Существует по крайней мере четыре различных, но связанных щелочных фосфатазы: кишечная (ALPI), плацентарная (этот фермент), плацентароподобная (ALPPL2) и ткань-неспецифическая (печени/костей/почек) (ALPL). Первые три расположены вместе на хромосоме 2, тогда как тканеспецифическая форма расположена на хромосоме 1. Кодирующая последовательность для этой формы щелочной фосфатазы уникальна тем, что 3'-нетранслируемая область содержит несколько копий повтора семейства Alu. Кроме того, этот ген является полиморфным, и три общих аллеля (тип 1, тип 2 и тип 3) для этой формы щелочной фосфатазы хорошо охарактеризованы^[7].

ФункцияПравить

Щелочная фосфатаза плацентарного типа представляет собой мембраносвязанный гликозилированный димерный фермент, также называемый термостойкой формой, который экспрессируется в основном в плаценте, хотя он тесно связан с кишечной, а также с плацентарноподобной формой^[7].

Клиническое значениеПравить

PLAP является онкомаркером, особенно при семиноме^[10]^[11]^[12] и раке яичников (например, дисгерминоме)^[13]. Уровень PLAP достоверен только для некурящих, поскольку курение мешает измерению PLAP^[14] поскольку сывороточные концентрации PLAP у курильщиков увеличиваются до 10 раз, и поэтому его измерение не имеет большого значения в этой группе^[15].

См. такжеПравить

ПримечанияПравить

↑ ¹ ² ³ GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000163283 - Ensembl, May 2017
↑ ¹ ² ³ GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000079440 - Ensembl, May 2017
↑ Ссылка на публикацию человека на PubMed: (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
↑ Ссылка на публикацию мыши на PubMed: (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
↑ “Cloning, sequencing, and chromosomal localization of human term placental alkaline phosphatase cDNA”. Proc Natl Acad Sci U S A. 82 (24): 8715—9. Feb 1986. DOI:10.1073/pnas.82.24.8715. PMID 3001717.
↑ “Products of two common alleles at the locus for human placental alkaline phosphatase differ by seven amino acids”. Proc Natl Acad Sci U S A. 83 (15): 5597—601. Sep 1986. DOI:10.1073/pnas.83.15.5597. PMID 3461452.
↑ ¹ ² ³ Entrez Gene: ALPP alkaline phosphatase, placental (Regan isozyme) (неопр.).
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:439 (англ.). Дата обращения: 28 августа 2017.
↑ UniProt, P05187 (англ.). Дата обращения: 28 августа 2017.
↑ European Group on Tumor Markers. A European Based Expert Group on Tumor Markers. Germ cell cancer. (неопр.) Архивировано 26 апреля 2012 года.
↑ W. Albrecht (2004). “Testicular tumor markers: Corner-stones in the management of malignant germ cell tumors” (PDF). J Lab Med. 28 (2): 109—115. DOI:10.1515/labmed.2004.018.
↑ Sturgeon C (August 2002). “Practice guidelines for tumor marker use in the clinic”. Clin. Chem. 48 (8): 1151—9. DOI:10.1093/clinchem/48.8.1151. PMID 12142367.
↑ Fishman WH (December 1987). “Clinical and biological significance of an isozyme tumor marker--PLAP”. Clin. Biochem. 20 (6): 387—92. DOI:10.1016/0009-9120(87)90003-8. PMID 3325192.
↑ “European consensus on diagnosis and treatment of germ cell cancer: a report of the European Germ Cell Cancer Consensus Group (EGCCCG)”. Annals of Oncology. 15 (9): 1377—99. September 2004. DOI:10.1093/annonc/mdh301. PMID 15319245.
↑ Tumor Markers in Testicular Cancers (неопр.). Архивировано 12 ноября 2010 года.

Дальнейшее чтениеПравить

Nye KE, Riley GA, Pinching AJ (1992). “The defect seen in the phosphatidylinositol hydrolysis pathway in HIV-infected lymphocytes and lymphoblastoid cells is due to inhibition of the inositol 1,4,5-trisphosphate 1,3,4,5-tetrakisphosphate 5-phosphomonoesterase”. Clin. Exp. Immunol. 89 (1): 89—93. DOI:10.1111/j.1365-2249.1992.tb06883.x. PMC 1554388. PMID 1321014.
Lowe ME (1992). “Site-specific mutations in the COOH-terminus of placental alkaline phosphatase: a single amino acid change converts a phosphatidylinositol-glycan-anchored protein to a secreted protein”. J. Cell Biol. 116 (3): 799—807. DOI:10.1083/jcb.116.3.799. PMC 2289307. PMID 1730777.
Micanovic R, Gerber LD, Berger J, Kodukula K, Udenfriend S (1990). “Selectivity of the cleavage/attachment site of phosphatidylinositol-glycan-anchored membrane proteins determined by site-specific mutagenesis at Asp-484 of placental alkaline phosphatase”. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 87 (1): 157—61. DOI:10.1073/pnas.87.1.157. PMC 53219. PMID 2153284.
Martin D, Spurr NK, Trowsdale J (1988). “RFLP of the human placental alkaline phosphatase gene (PLAP)”. Nucleic Acids Res. 15 (21): 9104. DOI:10.1093/nar/15.21.9104. PMC 306450. PMID 2891112.
Knoll BJ, Rothblum KN, Longley M (1988). “Nucleotide sequence of the human placental alkaline phosphatase gene. Evolution of the 5' flanking region by deletion/substitution”. J. Biol. Chem. 263 (24): 12020—7. PMID 3042787.
Micanovic R, Bailey CA, Brink L, Gerber L, Pan YC, Hulmes JD, Udenfriend S (1988). “Aspartic acid-484 of nascent placental alkaline phosphatase condenses with a phosphatidylinositol glycan to become the carboxyl terminus of the mature enzyme”. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 85 (5): 1398—402. DOI:10.1073/pnas.85.5.1398. PMC 279778. PMID 3422741.
Knoll BJ, Rothblum KN, Longley M (1988). “Two gene duplication events in the evolution of the human heat-stable alkaline phosphatases”. Gene. 60 (2—3): 267—76. DOI:10.1016/0378-1119(87)90235-6. PMID 3443302.
Ovitt CE, Strauss AW, Alpers DH, Chou JY, Boime I (1986). “Expression of different-sized placental alkaline phosphatase mRNAs in placenta and choriocarcinoma cells”. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 83 (11): 3781—5. DOI:10.1073/pnas.83.11.3781. PMC 323607. PMID 3459156.
Millán JL (1986). “Molecular cloning and sequence analysis of human placental alkaline phosphatase”. J. Biol. Chem. 261 (7): 3112—5. PMID 3512548.
Ezra E, Blacher R, Udenfriend S (1984). “Purification and partial sequencing of human placental alkaline phosphatase”. Biochem. Biophys. Res. Commun. 116 (3): 1076—83. DOI:10.1016/S0006-291X(83)80252-6. PMID 6651840.
Le Du MH, Stigbrand T, Taussig MJ, Menez A, Stura EA (2001). “Crystal structure of alkaline phosphatase from human placenta at 1.8 A resolution. Implication for a substrate specificity”. J. Biol. Chem. 276 (12): 9158—65. DOI:10.1074/jbc.M009250200. PMID 11124260.
Spurway TD, Dalley JA, High S, Bulleid NJ (2001). “Early events in glycosylphosphatidylinositol anchor addition. substrate proteins associate with the transamidase subunit gpi8p”. J. Biol. Chem. 276 (19): 15975—82. DOI:10.1074/jbc.M010128200. PMID 11278620.
Rump A, Kasper G, Hayes C, Wen G, Starke H, Liehr T, Lehmann R, Lagemann D, Rosenthal A (2001). “Complex arrangement of genes within a 220-kb region of double-duplicated DNA on human 2q37.1”. Genomics. 73 (1): 50—5. DOI:10.1006/geno.2000.6504. PMID 11352565.
Wennberg C, Kozlenkov A, Di Mauro S, Fröhlander N, Beckman L, Hoylaerts MF, Millán JL (2002). “Structure, genomic DNA typing, and kinetic characterization of the D allozyme of placental alkaline phosphatase (PLAP/ALPP)”. Hum. Mutat. 19 (3): 258—67. DOI:10.1002/humu.10052. PMID 11857742.
Kozlenkov A, Manes T, Hoylaerts MF, Millán JL (2002). “Function assignment to conserved residues in mammalian alkaline phosphatases”. J. Biol. Chem. 277 (25): 22992—9. DOI:10.1074/jbc.M202298200. PMID 11937510.
Tang J, Li W (2002). “[Methodological study on the assay of glycosylphosphatidylinositol-specific phospholipase D activity in serum]”. Hunan Yi Ke da Xue Xue Bao. 24 (2): 119—22. PMID 11938765.
Lehto MT, Sharom FJ (2002). “Proximity of the protein moiety of a GPI-anchored protein to the membrane surface: a FRET study”. Biochemistry. 41 (26): 8368—76. DOI:10.1021/bi012038+. PMID 12081485.
Le Du MH, Millan JL (2003). “Structural evidence of functional divergence in human alkaline phosphatases”. J. Biol. Chem. 277 (51): 49808—14. DOI:10.1074/jbc.M207394200. PMID 12372831.
Llinas P, Stura EA, Ménez A, Kiss Z, Stigbrand T, Millán JL, Le Du MH (July 2005). “Structural studies of human placental alkaline phosphatase in complex with functional ligands”. J. Mol. Biol. 350 (3): 441—51. DOI:10.1016/j.jmb.2005.04.068. PMID 15946677.

[refGRCh38Ensembl-1] ¹ ² ³ GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000163283 - Ensembl, May 2017

[refGRCm38Ensembl-2] ¹ ² ³ GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000079440 - Ensembl, May 2017

[3] Ссылка на публикацию человека на PubMed: (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[4] Ссылка на публикацию мыши на PubMed: (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[pmid3001717-5] “Cloning, sequencing, and chromosomal localization of human term placental alkaline phosphatase cDNA”. Proc Natl Acad Sci U S A. 82 (24): 8715—9. Feb 1986. DOI:10.1073/pnas.82.24.8715. PMID 3001717.

[pmid3461452-6] “Products of two common alleles at the locus for human placental alkaline phosphatase differ by seven amino acids”. Proc Natl Acad Sci U S A. 83 (15): 5597—601. Sep 1986. DOI:10.1073/pnas.83.15.5597. PMID 3461452.

[entrez-7] ¹ ² ³ Entrez Gene: ALPP alkaline phosphatase, placental (Regan isozyme) (неопр.).

[HGNC-8] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:439 (англ.). Дата обращения: 28 августа 2017.

[UniProt-9] UniProt, P05187 (англ.). Дата обращения: 28 августа 2017.

[egtm_tumour_markers_in_germ_cell_cancer-10] European Group on Tumor Markers. A European Based Expert Group on Tumor Markers. Germ cell cancer. (неопр.) Архивировано 26 апреля 2012 года.

[egtm_Albrecht-11] W. Albrecht (2004). “Testicular tumor markers: Corner-stones in the management of malignant germ cell tumors” (PDF). J Lab Med. 28 (2): 109—115. DOI:10.1515/labmed.2004.018.

[Practice_Guidelines_for_Tumor_Marker_Use_in_the_Clinic-12] Sturgeon C (August 2002). “Practice guidelines for tumor marker use in the clinic”. Clin. Chem. 48 (8): 1151—9. DOI:10.1093/clinchem/48.8.1151. PMID 12142367.

[pmid3325192-13] Fishman WH (December 1987). “Clinical and biological significance of an isozyme tumor marker--PLAP”. Clin. Biochem. 20 (6): 387—92. DOI:10.1016/0009-9120(87)90003-8. PMID 3325192.

[pmid15319245-14] “European consensus on diagnosis and treatment of germ cell cancer: a report of the European Germ Cell Cancer Consensus Group (EGCCCG)”. Annals of Oncology. 15 (9): 1377—99. September 2004. DOI:10.1093/annonc/mdh301. PMID 15319245.

[Tumor_Markers_in_Testicular_Cancers-15] Tumor Markers in Testicular Cancers (неопр.). Архивировано 12 ноября 2010 года.

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[1]

[2]

[3]

[4]

[10]

[11]

[12]

[13]

[14]

[15]