Некодирующие РНК

Некодирующие РНК (non-coding RNA, ncRNA) — молекулы РНК, которые не транслируются в белки. Ранее использовавшийся синоним — «малые РНК» (smRNA, small RNA) — вышел из употребления, так как некоторые некодирующие РНК могут быть очень большими, например, Xist.

Рибозим-лигаза класса I

Последовательность ДНК, на которой транскрибируются некодирующие РНК, часто называют РНК-геном.

К некодирующим РНК относят^[1]:

транспортные РНК (тРНК),
рибосомные РНК (рРНК),
малые ядерные РНК (мяРНК, snRNA),
малые ядрышковые РНК (мякРНК, snoRNA),
антисмысловые РНК (aRNA),
микроРНК (miRNA),
малые интерферирующие РНК (siRNA),
piРНК (piwiRNA, piRNA),
длинные некодирующие РНК (lncRNA) — Xist, Evf, Air, CTN, PINK, TUG1.

Последние транскриптомные технологии (секвенирование РНК) и методы ДНК-микрочипов выявили более 30000 длинных некодирующих РНК (англ. long ncRNA)^{[источник не указан 2439 дней]}. Предполагается, что они «руководят» избирательной посадкой репрессорных комплексов polycomb на определённые участки хроматина, а также направляют ДНК-метилтрансферазы и, возможно, регулируют избирательное метилирование ДНК^[2]^[3]^[4]^[5]. Более того, как оказалось, составляющие значительную часть (~20 % от общего количества длинных некодирующих РНК в геномах млекопитающих), так называемые дивергентные дднРНК, которые транскрибируются в противоположном направлении к соседним белок-кодирующим генам, регулируют транскрипцию этих соседних смежных генов^[6].

ПримечанияПравить

↑ Lee T. I., Young R. A. Transcriptional regulation and its misregulation in disease. (англ.) // Cell. — 2013. — Vol. 152, no. 6. — P. 1237—1251. — doi:10.1016/j.cell.2013.02.014. — PMID 23498934. [исправить]
↑ Merry, C. R., Forrest, M. E., Sabers, J. N., Beard, L., Gao, X. H., Hatzoglou, M., ... & Khalil, A. M. DNMT1-associated long non-coding RNAs regulate global gene expression and DNA methylation in colon cancer // Human molecular genetics. — 2015. — Т. 24, № 21. — С. 6240—6253. — doi:10.1093/hmg/ddv343.
↑ Managing Methylation (неопр.). Дата обращения: 19 июля 2022. Архивировано 28 ноября 2016 года.
↑ Daniel Holoch & Danesh Moazed. RNA-mediated epigenetic regulation of gene expression // Nature reviews. Genetics. — 2015. — Т. 16, № 2. — С. 71–84. — doi:10.1038/nrg3863. — PMID 25554358.
↑ Jeffrey J. Quinn & Howard Y. Chang. Unique features of long non-coding RNA biogenesis and function // Nature reviews. Genetics. — 2015. — Т. 17, № 1. — С. 47–62. — doi:10.1038/nrg.2015.10. — PMID 26666209.
↑ Sai Luo, J. Yuyang Lu, Lichao Liu, et al., & Xiaohua Shen. Divergent lncRNAs Regulate Gene Expression and Lineage Differentiation in Pluripotent Cells // Cell Stem Cell. — 2016. — doi:10.1016/j.stem.2016.01.024.

СсылкиПравить

Ishitani R, Yokoyama S, Nureki O. Structure, dynamics, and function of RNA modification enzymes // Curr Opin Struct Biol. — 2008. — Т. 18, № 3. — С. 330—339.
Yeung ML, Benkirane M, Jeang KT. Small non-coding RNAs, mammalian cells, and viruses: regulatory interactions? // Retrovirology. — 2007. — Т. 4. — С. 74.

См. такжеПравить

Секвенирование РНК
Ультраконсервативные элементы ДНК
Длинные и короткие некодирующие РНК (lncRNA и miRNA), взаимодействующие с репрессорными комплексами поликомб.

[Lee2013-1] Lee T. I., Young R. A. Transcriptional regulation and its misregulation in disease. (англ.) // Cell. — 2013. — Vol. 152, no. 6. — P. 1237—1251. — doi:10.1016/j.cell.2013.02.014. — PMID 23498934. [исправить]

[2] Merry, C. R., Forrest, M. E., Sabers, J. N., Beard, L., Gao, X. H., Hatzoglou, M., ... & Khalil, A. M. DNMT1-associated long non-coding RNAs regulate global gene expression and DNA methylation in colon cancer // Human molecular genetics. — 2015. — Т. 24, № 21. — С. 6240—6253. — doi:10.1093/hmg/ddv343.

[3] Managing Methylation (неопр.). Дата обращения: 19 июля 2022. Архивировано 28 ноября 2016 года.

[4] Daniel Holoch & Danesh Moazed. RNA-mediated epigenetic regulation of gene expression // Nature reviews. Genetics. — 2015. — Т. 16, № 2. — С. 71–84. — doi:10.1038/nrg3863. — PMID 25554358.

[5] Jeffrey J. Quinn & Howard Y. Chang. Unique features of long non-coding RNA biogenesis and function // Nature reviews. Genetics. — 2015. — Т. 17, № 1. — С. 47–62. — doi:10.1038/nrg.2015.10. — PMID 26666209.

[6] Sai Luo, J. Yuyang Lu, Lichao Liu, et al., & Xiaohua Shen. Divergent lncRNAs Regulate Gene Expression and Lineage Differentiation in Pluripotent Cells // Cell Stem Cell. — 2016. — doi:10.1016/j.stem.2016.01.024.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]