Подопланин

Подопланин
Подопланин
Доступные структуры
Доступные структуры
PDB	Поиск ортологов: PDBe RCSB
Список идентификаторов PDB
Список идентификаторов PDB
	3WSR, 4YO0
Идентификаторы
Псевдонимы	PDPN, AGGRUS, GP36, GP40, Gp38, HT1A-1, OTS8, PA2.26, T1A, T1A-2, T1A2, TI1A, podoplanin, D2-40
Внешние ID	OMIM: 608863 MGI: 103098 HomoloGene: 4729 GeneCards: PDPN
Расположение гена (человек)
Расположение гена (человек)
Хр.	1-я хромосома человека
Конец	13,617,957 bp
Расположение гена (Мышь)
Расположение гена (Мышь)
Хр.	4-я хромосома мыши
Конец	143,026,134 bp
Паттерн экспрессии РНК
Паттерн экспрессии РНК
	Наибольшая экспрессия в
	germinal epithelium; ; secondary oocyte; ; parietal pleura; ; left uterine tube;
	Наибольшая экспрессия в
	secondary oocyte; ; cредний мозг;
	Дополнительные справочные данные
	; ;
	Дополнительные справочные данные
Генная онтология
Генная онтология
Молекулярная функция	folic acid transmembrane transporter activity; water channel activity; amino acid transmembrane transporter activity; water transmembrane transporter activity; signaling receptor binding; связывание с белками плазмы; chaperone binding; chemokine binding;
Компонент клетки	часть мембраны; часть клеточной мембраны; клеточная мембрана; мембрана; tetraimgin-enriched microdomain; lamellipodium membrane; цитоплазматическая везикула; filopodium membrane; microvillus membrane; ruffle membrane; cell projection; leading edge of lamellipodium; цитоплазма; цитозоль; basolateral plasma membrane; apical plasma membrane; Межклеточные контакты; Липидный рафт; ruffle; lamellipodium; filopodium;
Биологический процесс	folic acid transport; транспорт воды; platelet activation; multicellular organism development; regulation of cell shape; amino acid transport; positive regulation of epithelial to mesenchymal transition; positive regulation of cell migration; Rho protein signal transduction; wound healing, spreading of cells; positive regulation of extracellular matrix disassembly; regulation of lamellipodium morphogenesis; cell morphogenesis; lymphangiogenesis; негативная регуляция пролиферации клеток; развитие лёгких; негативная регуляция апоптоза; развитие лимфатического узла; lymphatic endothelial cell fate commitment; actin-mediated cell contraction; regulation of substrate adhesion-dependent cell spreading; positive regulation of platelet aggregation; regulation of myofibroblast contraction; amino acid transmembrane transport;
	Источники: Amigo, QuickGO
Ортологи
Ортологи
	10630
	14726
	ENSG00000162493
	ENSMUSG00000028583
	Q86YL7
	Q62011
NM_001006624; NM_001006625; NM_006474; NM_198389; NM_001385053;
	NM_013317
	NM_001290822; NM_010329
	NP_001006625; NP_001006626; NP_006465; NP_938203
	NP_001277751; NP_034459
	Информация в Викиданных
Смотреть (человек)	Смотреть (мышь)

Подопланин (англ. Podoplanin, PDPN) — белок, кодируемый геном PDPN^[5]^[6]^[7].

Структура и функцияПравить

Подопланин — интегральный мембранный белок типа I, сильно O-гликозилированный гликопротеин типа муцинов, с молекулярной массой 36—43 кДа. В царстве животных это достаточно консервативный белок: его гомологи есть у человека, мышей, крыс, собак и хомяков^[8].

Подопланин широко распространён в тканях человека. Гомологи данного белка у других видов выполняют функцию антигенов дифференцировки и рецепторов вируса гриппа. Конкретная функция белка у человека не идентифицирована, но предполагается, что он может быть маркером повреждения лёгких. Были получены альтернативно сплайсированные варианты, кодирующие разные изоформы^[7].

Было обнаружено, что подопланин функционирует в альвеолярных клетках лёгких, подоцитах почек и клетках эндотелия лимфатической системы. Также этот белок был обнаружен в образцах нервной ткани мышей и человека^[9]. Кроме того, было продемонстрировано, что подопланин играет роль в разделении лимфатической и кровеносной системе во время эмбрионального развития, а его дефицит приводит к стеатозу печени у мышей^[9].

Хотя конкретная функция подопланина неизвестна, была отмечена его колокализация с белком промежуточных филаментов нестином^[en], который экспрессируется практически исключительно в нервной ткани^[10]. По состоянию на 2013 год, единственный белок, с которым как известно взаимодействует подопланин — это лектин-подобный рецептор CLEC-2 (англ. C-type lectin-like receptor 2)^[11]. Оба этих белка играют роль в правильном формировании связей лимфатической и кровеносной систем во время эмбрионального развития.

Клиническое значениеПравить

Подопланин активно изучается онкологами. Он является специфичным маркером лимфатических сосудов. Поскольку лимфангиогенез (формирование новых лимфатических сосудов) коррелирует с плохим прогнозом у раковых больных, подопланин может быть полезным диагностическим маркером^[8]. Отмечена положительная регуляция подопланина в различных видах опухолей, например в нескольких видах карциномы плоского эпителия, злокачественной мезотелиоме и опухолях мозга^[8]. Кроме того, он положительно регулируется ассоциированными с опухолью фибробластами (англ. cancer-associated fibroblasts (CAFs)) в опухолевой строме^[8]^[12], что ассоциируется с неблагоприятным прогнозом течения болезни^[13].

В карциномах плоского эпителия подопланин играет ключевую роль в инвазивности раковых клеток, контролируя инвадоподии^[en], что обеспечивает эффективную деградацию внеклеточного матрикса^[14].

ПримечанияПравить

↑ ¹ ² ³ GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000162493 - Ensembl, May 2017
↑ ¹ ² ³ GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000028583 - Ensembl, May 2017
↑ Ссылка на публикацию человека на PubMed: (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
↑ Ссылка на публикацию мыши на PubMed: (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
↑ Zimmer G., Oeffner F., Von Messling V., Tschernig T., Gröness H. J., Klenk H. D., Herrler G. Cloning and characterization of gp36, a human mucin-type glycoprotein preferentially expressed in vascular endothelium. (англ.) // The Biochemical journal. — 1999. — Vol. 341 ( Pt 2). — P. 277—284. — PMID 10393083. [исправить]
↑ Ma T., Yang B., Matthay M. A., Verkman A. S. Evidence against a role of mouse, rat, and two cloned human t1alpha isoforms as a water channel or a regulator of aquaporin-type water channels. (англ.) // American journal of respiratory cell and molecular biology. — 1998. — Vol. 19, no. 1. — P. 143—149. — doi:10.1165/ajrcmb.19.1.2953. — PMID 9651190. [исправить]
↑ ¹ ² Entrez Gene: PDPN podoplanin (неопр.).
↑ ¹ ² ³ ⁴ Astarita J. L., Acton S. E., Turley S. J. Podoplanin: emerging functions in development, the immune system, and cancer. (англ.) // Frontiers in immunology. — 2012. — Vol. 3. — P. 283. — doi:10.3389/fimmu.2012.00283. — PMID 22988448. [исправить]
↑ ¹ ² Fu J., Gerhardt H., McDaniel J. M., Xia B., Liu X., Ivanciu L., Ny A., Hermans K., Silasi-Mansat R., McGee S., Nye E., Ju T., Ramirez M. I., Carmeliet P., Cummings R. D., Lupu F., Xia L. Endothelial cell O-glycan deficiency causes blood/lymphatic misconnections and consequent fatty liver disease in mice. (англ.) // The Journal of clinical investigation. — 2008. — Vol. 118, no. 11. — P. 3725—3737. — doi:10.1172/JCI36077. — PMID 18924607. [исправить]
↑ Imaizumi Y., Amano I., Tsuruga E., Kojima H., Sawa Y. Immunohistochemical examination for the distribution of podoplanin-expressing cells in developing mouse molar tooth germs. (англ.) // Acta histochemica et cytochemica. — 2010. — Vol. 43, no. 5. — P. 115—121. — doi:10.1267/ahc.10023. — PMID 21060740. [исправить]
↑ Herzog B. H., Fu J., Wilson S. J., Hess P. R., Sen A., McDaniel J. M., Pan Y., Sheng M., Yago T., Silasi-Mansat R., McGee S., May F., Nieswandt B., Morris A. J., Lupu F., Coughlin S. R., McEver R. P., Chen H., Kahn M. L., Xia L. Podoplanin maintains high endothelial venule integrity by interacting with platelet CLEC-2. (англ.) // Nature. — 2013. — Vol. 502, no. 7469. — P. 105—109. — doi:10.1038/nature12501. — PMID 23995678. [исправить]
↑ Kitano H., Kageyama S., Hewitt S. M., Hayashi R., Doki Y., Ozaki Y., Fujino S., Takikita M., Kubo H., Fukuoka J. Podoplanin expression in cancerous stroma induces lymphangiogenesis and predicts lymphatic spread and patient survival. (англ.) // Archives of pathology & laboratory medicine. — 2010. — Vol. 134, no. 10. — P. 1520—1527. — doi:10.1043/2009-0114-OA.1. — PMID 20923309. [исправить]
↑ Chuang W. Y., Yeh C. J., Chao Y. K., Liu Y. H., Chang Y. S., Tseng C. K., Chang H. K., Wan Y. L., Hsueh C. Concordant podoplanin expression in cancer-associated fibroblasts and tumor cells is an adverse prognostic factor in esophageal squamous cell carcinoma. (англ.) // International journal of clinical and experimental pathology. — 2014. — Vol. 7, no. 8. — P. 4847—4856. — PMID 25197355. [исправить]
↑ Martín-Villar E., Borda-d'Agua B., Carrasco-Ramirez P., Renart J., Parsons M., Quintanilla M., Jones G. E. Podoplanin mediates ECM degradation by squamous carcinoma cells through control of invadopodia stability. (англ.) // Oncogene. — 2015. — Vol. 34, no. 34. — P. 4531—4544. — doi:10.1038/onc.2014.388. — PMID 25486435. [исправить]

[refGRCh38Ensembl-1] ¹ ² ³ GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000162493 - Ensembl, May 2017

[refGRCm38Ensembl-2] ¹ ² ³ GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000028583 - Ensembl, May 2017

[3] Ссылка на публикацию человека на PubMed: (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[4] Ссылка на публикацию мыши на PubMed: (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[pmid10393083-5] Zimmer G., Oeffner F., Von Messling V., Tschernig T., Gröness H. J., Klenk H. D., Herrler G. Cloning and characterization of gp36, a human mucin-type glycoprotein preferentially expressed in vascular endothelium. (англ.) // The Biochemical journal. — 1999. — Vol. 341 ( Pt 2). — P. 277—284. — PMID 10393083. [исправить]

[pmid9651190-6] Ma T., Yang B., Matthay M. A., Verkman A. S. Evidence against a role of mouse, rat, and two cloned human t1alpha isoforms as a water channel or a regulator of aquaporin-type water channels. (англ.) // American journal of respiratory cell and molecular biology. — 1998. — Vol. 19, no. 1. — P. 143—149. — doi:10.1165/ajrcmb.19.1.2953. — PMID 9651190. [исправить]

[entrez-7] ¹ ² Entrez Gene: PDPN podoplanin (неопр.).

[pmid22988448-8] ¹ ² ³ ⁴ Astarita J. L., Acton S. E., Turley S. J. Podoplanin: emerging functions in development, the immune system, and cancer. (англ.) // Frontiers in immunology. — 2012. — Vol. 3. — P. 283. — doi:10.3389/fimmu.2012.00283. — PMID 22988448. [исправить]

[pmid18924607-9] ¹ ² Fu J., Gerhardt H., McDaniel J. M., Xia B., Liu X., Ivanciu L., Ny A., Hermans K., Silasi-Mansat R., McGee S., Nye E., Ju T., Ramirez M. I., Carmeliet P., Cummings R. D., Lupu F., Xia L. Endothelial cell O-glycan deficiency causes blood/lymphatic misconnections and consequent fatty liver disease in mice. (англ.) // The Journal of clinical investigation. — 2008. — Vol. 118, no. 11. — P. 3725—3737. — doi:10.1172/JCI36077. — PMID 18924607. [исправить]

[pmid21060740-10] Imaizumi Y., Amano I., Tsuruga E., Kojima H., Sawa Y. Immunohistochemical examination for the distribution of podoplanin-expressing cells in developing mouse molar tooth germs. (англ.) // Acta histochemica et cytochemica. — 2010. — Vol. 43, no. 5. — P. 115—121. — doi:10.1267/ahc.10023. — PMID 21060740. [исправить]

[11] Herzog B. H., Fu J., Wilson S. J., Hess P. R., Sen A., McDaniel J. M., Pan Y., Sheng M., Yago T., Silasi-Mansat R., McGee S., May F., Nieswandt B., Morris A. J., Lupu F., Coughlin S. R., McEver R. P., Chen H., Kahn M. L., Xia L. Podoplanin maintains high endothelial venule integrity by interacting with platelet CLEC-2. (англ.) // Nature. — 2013. — Vol. 502, no. 7469. — P. 105—109. — doi:10.1038/nature12501. — PMID 23995678. [исправить]

[12] Kitano H., Kageyama S., Hewitt S. M., Hayashi R., Doki Y., Ozaki Y., Fujino S., Takikita M., Kubo H., Fukuoka J. Podoplanin expression in cancerous stroma induces lymphangiogenesis and predicts lymphatic spread and patient survival. (англ.) // Archives of pathology & laboratory medicine. — 2010. — Vol. 134, no. 10. — P. 1520—1527. — doi:10.1043/2009-0114-OA.1. — PMID 20923309. [исправить]

[13] Chuang W. Y., Yeh C. J., Chao Y. K., Liu Y. H., Chang Y. S., Tseng C. K., Chang H. K., Wan Y. L., Hsueh C. Concordant podoplanin expression in cancer-associated fibroblasts and tumor cells is an adverse prognostic factor in esophageal squamous cell carcinoma. (англ.) // International journal of clinical and experimental pathology. — 2014. — Vol. 7, no. 8. — P. 4847—4856. — PMID 25197355. [исправить]

[14] Martín-Villar E., Borda-d'Agua B., Carrasco-Ramirez P., Renart J., Parsons M., Quintanilla M., Jones G. E. Podoplanin mediates ECM degradation by squamous carcinoma cells through control of invadopodia stability. (англ.) // Oncogene. — 2015. — Vol. 34, no. 34. — P. 4531—4544. — doi:10.1038/onc.2014.388. — PMID 25486435. [исправить]

[5]

[6]

[7]

[1]

[2]

[3]

[4]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]

[13]

[14]