SRF (белок)

Фактор реагирования на сыворотку (англ. Serum response factor, сокращённо SRF) является членом семейства транскрипционных факторов MADS-box. SRF является вездесущим и высококонсервативным фактором транскрипции, который влияет на обширный список из более чем 8000 генов-мишеней, включая собственный ген в качестве основной мишени. Он обычно связывается с консервативными последовательностями, так называемого элемента ответа сыворотки (SRE), которые в основном расположены в промоторных областях генов мышц и факторов роста. Ген кодирующий SRF у человека расположен на хромосоме 6p21.1 и состоит из семи экзонов. Известно четыре варианта сплайсинга SRF, причем самый большой вариант содержит все 7 экзонов. Белок SRF массой 67 кДа содержит 508 аминокислот и состоит из домена активации транскрипции и эволюционно законсервированного MADS-бокса с ДНК-связывающим доменом, доменом димеризации и несколькими доменами, связывающими кофакторы.

SRF (белок)
Доступные структуры PDB Поиск ортологов: PDBe RCSB Список идентификаторов PDB 1HBX, 1K6O, 1SRS
Идентификаторы
Псевдонимы	SRF, MCM1, serum response factor
Внешние ID	OMIM: 600589 MGI: 106658 HomoloGene: 31135 GeneCards: SRF
Расположение гена (человек) Хр. 6-я хромосома человека Локус 6p21.1 Начало 43,171,269 bp Конец 43,181,506 bp
Расположение гена (Мышь) Хр. 17-я хромосома мыши Локус 17|17 C Начало 46,859,255 bp Конец 46,867,101 bp
Паттерн экспрессии РНК Bgee Человек Мышь (ортолог) Наибольшая экспрессия в left uterine tube popliteal artery saphenous vein Наибольшая экспрессия в skeletal muscle tissue secondary oocyte Дополнительные справочные данные BioGPS Дополнительные справочные данные
Генная онтология Молекулярная функция protein dimerization activity DNA-binding transcription factor activity DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific RNA polymerase II general transcription initiation factor activity primary miRNA binding transcription factor binding RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding гомодимеризация белка serum response element binding chromatin binding связывание с белками плазмы ДНК-связывающий sequence-specific DNA binding transcription factor activity, RNA polymerase II distal enhancer sequence-specific binding chromatin DNA binding transcription factor activity, RNA polymerase II core promoter proximal region sequence-specific binding cis-regulatory region sequence-specific DNA binding DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific histone deacetylase binding RNA polymerase II-specific DNA-binding transcription factor binding Компонент клетки цитоплазма клеточное ядро нуклеоплазма Биологический процесс dorsal aorta morphogenesis bronchus cartilage development muscle cell cellular homeostasis lung smooth muscle development regulation of water loss via skin transcription by RNA polymerase II stress fiber assembly cell migration involved in sprouting angiogenesis platelet activation cardiac myofibril assembly heart looping клеточное старение face development regulation of cell adhesion long-term depression neuron projection development morphogenesis of an epithelial sheet positive regulation of filopodium assembly primitive streak formation cellular response to glucose stimulus негативная регуляция пролиферации клеток response to cytokine ДНК-зависимая регуляция транскрипции heart trabecula formation actin filament organization thymus development angiogenesis involved in wound healing Тромбопоэз neuron development in utero embryonic development транскрипция, ДНК-зависимая ДНК-зависимая позитивная регуляция транскрипции развитие сердца positive regulation of cell differentiation branching involved in blood vessel morphogenesis positive regulation of axon extension positive regulation of smooth muscle contraction trachea cartilage development response to toxic substance positive regulation of pri-miRNA transcription by RNA polymerase II positive regulation of transcription by glucose regulation of smooth muscle cell differentiation epithelial structure maintenance associative learning skin morphogenesis positive regulation of DNA-binding transcription factor activity epithelial cell-cell adhesion neuron migration positive regulation of transcription initiation from RNA polymerase II promoter eyelid development in camera-type eye развитие щитовидной железы negative regulation of amyloid-beta clearance negative regulation of cell migration developmental growth hematopoietic stem cell differentiation Гаструляция trophectodermal cell differentiation positive thymic T cell selection response to hormone cell-matrix adhesion sarcomere organization actin cytoskeleton organization megakaryocyte development response to hypoxia lung morphogenesis mesoderm formation cardiac vascular smooth muscle cell differentiation mRNA transcription by RNA polymerase II multicellular organism development tangential migration from the subventricular zone to the olfactory bulb долговременная память contractile actin filament bundle assembly bicellular tight junction assembly leukocyte differentiation развитие гиппокампа положительная регуляция транскрипции РНК полимеразой II промотор erythrocyte development negative regulation of pri-miRNA transcription by RNA polymerase II развитие переднего мозга cell-cell adhesion Источники: Amigo, QuickGO
Ортологи Вид Человек Мышь Entrez 6722 20807 Ensembl ENSG00000112658 ENSMUSG00000015605 UniProt P11831 Q9JM73 RefSeq (мРНК) NM_003131 NM_001292001 NM_020493 RefSeq (белок) NP_001278930 NP_003122 NP_003122.1 NP_065239 Локус (UCSC) Chr 6: 43.17 – 43.18 Mb Chr 17: 46.86 – 46.87 Mb Поиск по PubMed Искать Искать
Информация в Викиданных
Смотреть (человек) Смотреть (мышь)

Развитие сердца во время эмбриогенеза позвоночных зависит от SRF, поскольку этот фактор необходим для образования саркомеров и первого сердечного сокращения.