SMC4

SMC4
SMC4
Доступные структуры
Доступные структуры
PDB	Поиск ортологов: PDBe RCSB
Список идентификаторов PDB
Список идентификаторов PDB
	4U4P
Идентификаторы
Псевдонимы	SMC4, CAP-C, CAPC, SMC-4, SMC4L1, hCAP-C, structural maintenance of chromosomes 4
Внешние ID	OMIM: 605575 MGI: 1917349 HomoloGene: 4015 GeneCards: SMC4
Расположение гена (человек)
Расположение гена (человек)
Хр.	3-я хромосома человека
Конец	160,434,954 bp
Расположение гена (Мышь)
Расположение гена (Мышь)
Хр.	3-я хромосома мыши
Конец	68,941,956 bp
Паттерн экспрессии РНК
Паттерн экспрессии РНК
	Наибольшая экспрессия в
	secondary oocyte; ; visceral pleura;
	Наибольшая экспрессия в
	maxillary prominence; ; primitive streak; ; seminiferous tubule;
	Дополнительные справочные данные
	; ;
	Дополнительные справочные данные
Генная онтология
Генная онтология
Молекулярная функция	protein heterodimerization activity; нуклеотид-связывающий; связывание с белками плазмы; АТФ-связанные; single-stranded DNA binding;
Компонент клетки	хромосома; клеточное ядро; Конденсин; нуклеоплазма; цитоплазма; цитозоль; Ядерные спеклы;
Биологический процесс	mitotic sister chromatid segregation; meiotic chromosome segregation; деление клетки; клеточный цикл; kinetochore organization; mitotic chromosome condensation; meiotic chromosome condensation; chromosome condensation; chromosome organization;
	Источники: Amigo, QuickGO
Ортологи
Ортологи
	10051
	70099
	ENSG00000113810
	ENSMUSG00000034349
	Q9NTJ3
	Q8CG47
	NM_001002799; NM_001002800; NM_001288753; NM_005496
	NM_133786; NM_001356976
	NP_001002800; NP_001275682; NP_005487
	NP_598547; NP_001343905
	Информация в Викиданных
Смотреть (человек)	Смотреть (мышь)

SMC4, или белок структурной поддержки хромосом номер четыре (англ. Structural maintenance of chromosomes protein 5), также известный как хромосом-ассоцированный полипептид C или XCAP-C гомолог — это белок, который у человека кодируется геном SMC4^[5]^[6]^[7]. SMC4 — основная субъединица комплекса конденсина I и II, большого мультибелкового комплекса, участвующего в конденсации хромосом^[8].

ФункцииПравить

SMC4 имеет обширный ряд функций важных для развития организма человека. В основном они участвуют в конденсации и сегрегации хромосом, а также в неклеточных функций хромосом, таких как поддержание подавленного состояния экспрессии генов, организация гетерохроматина и восстановление ДНК^[9].

Роль SMC4 в развитии карциномыПравить

SMC4 участвует в опухолевом процессе печени, толстой кишки и лёгких. Этот белок тесно связан с клеточным циклом, клеточной адгезией и обработкой РНК в развитии лёгких и канцерогенезе. Он сверхэкспрессируется в тканях аденокарциномы лёгких и действует как независимый прогностический фактор. Поражение SMC4 сильно подавляет пролиферацию и инвазию клеток A549, белок также взаимодействует с DDX46. Ключевая роль белка в развитии лёгких и канцерогенезе показывает, что гены с аналогичным паттерном экспрессии SMC4 в развитии лёгких могут способствовать прогрессированию рака лёгких^[9].

ПримечанияПравить

↑ ¹ ² ³ GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000113810 - Ensembl, May 2017
↑ ¹ ² ³ GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000034349 - Ensembl, May 2017
↑ Ссылка на публикацию человека на PubMed: (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
↑ Ссылка на публикацию мыши на PubMed: (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
↑ Schmiesing J.A., Ball AR Jr, Gregson H.C., Alderton J.M., Zhou S., Yokomori K. Identification of two distinct human SMC protein complexes involved in mitotic chromosome dynamics (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 1998. — November (vol. 95, no. 22). — P. 12906—12911. — doi:10.1073/pnas.95.22.12906. — PMID 9789013.
↑ Nishiwaki T., Daigo Y., Kawasoe T., Nagasawa Y., Ishiguro H., Fujita M., Furukawa Y., Nakamura Y. Isolation and characterization of a human cDNA homologous to the Xenopus laevis XCAP-C gene belonging to the structural maintenance of chromosomes (SMC) family (англ.) // J Hum Genet (англ.) (рус. : journal. — 1999. — June (vol. 44, no. 3). — P. 197—202. — doi:10.1007/s100380050142. — PMID 10319587.
↑ Entrez Gene: SMC4 structural maintenance of chromosomes 4 (неопр.). Архивировано 5 декабря 2010 года.
↑ Alliance of Genome Resources (неопр.). www.alliancegenome.org. Дата обращения: 15 августа 2021. Архивировано 15 августа 2021 года.
↑ ¹ ² Chengli Zhang, Manchao Kuang, Meng Li, Lin Feng, Kaitai Zhang. SMC4, which is essentially involved in lung development, is associated with lung adenocarcinoma progression (англ.) // Scientific Reports. — 2016-09-30. — Vol. 6, iss. 1. — P. 34508. — ISSN 2045-2322. — doi:10.1038/srep34508. Архивировано 15 августа 2021 года.

[refGRCh38Ensembl-1] ¹ ² ³ GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000113810 - Ensembl, May 2017

[refGRCm38Ensembl-2] ¹ ² ³ GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000034349 - Ensembl, May 2017

[3] Ссылка на публикацию человека на PubMed: (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[4] Ссылка на публикацию мыши на PubMed: (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[pmid9789013-5] Schmiesing J.A., Ball AR Jr, Gregson H.C., Alderton J.M., Zhou S., Yokomori K. Identification of two distinct human SMC protein complexes involved in mitotic chromosome dynamics (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 1998. — November (vol. 95, no. 22). — P. 12906—12911. — doi:10.1073/pnas.95.22.12906. — PMID 9789013.

[pmid10319587-6] Nishiwaki T., Daigo Y., Kawasoe T., Nagasawa Y., Ishiguro H., Fujita M., Furukawa Y., Nakamura Y. Isolation and characterization of a human cDNA homologous to the Xenopus laevis XCAP-C gene belonging to the structural maintenance of chromosomes (SMC) family (англ.) // J Hum Genet (англ.) (рус. : journal. — 1999. — June (vol. 44, no. 3). — P. 197—202. — doi:10.1007/s100380050142. — PMID 10319587.

[entrez-7] Entrez Gene: SMC4 structural maintenance of chromosomes 4 (неопр.). Архивировано 5 декабря 2010 года.

[8] Alliance of Genome Resources (неопр.). www.alliancegenome.org. Дата обращения: 15 августа 2021. Архивировано 15 августа 2021 года.

[:0-9] ¹ ² Chengli Zhang, Manchao Kuang, Meng Li, Lin Feng, Kaitai Zhang. SMC4, which is essentially involved in lung development, is associated with lung adenocarcinoma progression (англ.) // Scientific Reports. — 2016-09-30. — Vol. 6, iss. 1. — P. 34508. — ISSN 2045-2322. — doi:10.1038/srep34508. Архивировано 15 августа 2021 года.

[5]

[6]

[7]

[8]

[1]

[2]

[3]

[4]

[9]