SERBP1

СЕРПИН1 мРНК связывающий белок 1
СЕРПИН1 мРНК связывающий белок 1
Доступные структуры
PDB
	Список идентификаторов PDB 3J3A
Идентификаторы
Символ
Внешние ID
Функция	• mRNA 3'-UTR binding; • protein binding; • poly(A) RNA binding;
Компонент клетки	• nucleus; • cytoplasm; • plasma membrane; • membrane; • perinuclear region of cytoplasm; • extracellular vesicular exosome;
Биологический процесс	• regulation of apoptotic process; • regulation of mRNA stability;
	Источники: Amigo / QuickGO
Профиль экспрессии РНК
	Больше информации
Ортологи

Ингибитор активатора плазминогена 1 РНК-связывающий белок SERBP1 (не следует путать с srebp1) — белок, который у человека кодируется геном SERBP1 .^[1]^[2]^[3]

ВзаимодействияПравить

SERBP1, как было выявлено, взаимодействует с CHD3.^[4]^[5]

ПримечанияПравить

↑ Heaton J.H., Dlakic W.M., Dlakic M., Gelehrter T.D. Identification and cDNA cloning of a novel RNA-binding protein that interacts with the cyclic nucleotide-responsive sequence in the Type-1 plasminogen activator inhibitor mRNA (англ.) // J Biol Chem : journal. — 2001. — May (vol. 276, no. 5). — P. 3341—3347. — doi:10.1074/jbc.M006538200. — PMID 11001948.
↑ Lai C.H., Chou C.Y., Ch'ang L.Y., Liu C.S., Lin W. Identification of novel human genes evolutionarily conserved in Caenorhabditis elegans by comparative proteomics (англ.) // Genome Res (англ.) (рус. : journal. — 2000. — August (vol. 10, no. 5). — P. 703—713. — doi:10.1101/gr.10.5.703. — PMID 10810093. — PMC 310876.
↑ Entrez Gene: SERBP1 SERPINE1 mRNA binding protein 1 (неопр.). Архивировано 5 декабря 2010 года.
↑ Lemos, Taíla A; Passos Dario O; Nery Flávia C; Kobarg Jörg. Characterization of a new family of proteins that interact with the C-terminal region of the chromatin-remodeling factor CHD-3 (англ.) // FEBS Lett. (англ.) (рус. : journal. — Netherlands, 2003. — January (vol. 533, no. 1—3). — P. 14—20. — ISSN 0014-5793. — doi:10.1016/S0014-5793(02)03737-7. — PMID 12505151.
↑ Stelzl, Ulrich; Worm Uwe, Lalowski Maciej, Haenig Christian, Brembeck Felix H., Goehler Heike, Stroedicke Martin, Zenkner Martina, Schoenherr Anke, Koeppen Susanne, Timm Jan, Mintzlaff Sascha, Abraham Claudia, Bock Nicole, Kietzmann Silvia, Goedde Astrid, Toksöz Engin, Droege Anja, Krobitsch Sylvia, Korn Bernhard, Birchmeier Walter, Lehrach Hans, Wanker Erich E. A human protein-protein interaction network: a resource for annotating the proteome (англ.) // Cell : journal. — United States: Cell Press, 2005. — September (vol. 122, no. 6). — P. 957—968. — ISSN 0092-8674. — doi:10.1016/j.cell.2005.08.029. — PMID 16169070.

ЛитератураПравить

Maruyama K., Sugano S. Oligo-capping: a simple method to replace the cap structure of eukaryotic mRNAs with oligoribonucleotides. (англ.) // Gene (англ.) (рус. : journal. — Elsevier, 1994. — Vol. 138, no. 1—2. — P. 171—174. — doi:10.1016/0378-1119(94)90802-8. — PMID 8125298.
Andersson B., Wentland M.A., Ricafrente J.Y., et al. A "double adaptor" method for improved shotgun library construction. (англ.) // Anal. Biochem. (англ.) (рус. : journal. — 1996. — Vol. 236, no. 1. — P. 107—113. — doi:10.1006/abio.1996.0138. — PMID 8619474.
Yu W., Andersson B., Worley K.C., et al. Large-scale concatenation cDNA sequencing. (англ.) // Genome Res. (англ.) (рус. : journal. — 1997. — Vol. 7, no. 4. — P. 353—358. — doi:10.1101/gr.7.4.353. — PMID 9110174. — PMC 139146.
Suzuki Y., Yoshitomo-Nakagawa K., Maruyama K., et al. Construction and characterization of a full length-enriched and a 5'-end-enriched cDNA library. (англ.) // Gene (англ.) (рус. : journal. — Elsevier, 1997. — Vol. 200, no. 1—2. — P. 149—156. — doi:10.1016/S0378-1119(97)00411-3. — PMID 9373149.
Wiemann S., Weil B., Wellenreuther R., et al. Toward a catalog of human genes and proteins: sequencing and analysis of 500 novel complete protein coding human cDNAs. (англ.) // Genome Res. (англ.) (рус. : journal. — 2001. — Vol. 11, no. 3. — P. 422—435. — doi:10.1101/gr.GR1547R. — PMID 11230166. — PMC 311072.
Bucková D., Izakovicová Hollá L., Vácha J. Polymorphism 4G/5G in the plasminogen activator inhibitor-1 (PAI-1) gene is associated with IgE-mediated allergic diseases and asthma in the Czech population. (англ.) // Allergy : journal. — 2002. — Vol. 57, no. 5. — P. 446—448. — doi:10.1034/j.1398-9995.2002.03582.x. — PMID 11972486.
Jones K., Powell J., Brown L., et al. The influence of 4G/5G polymorphism in the plasminogen activator inhibitor-1 gene promoter on the incidence, growth and operative risk of abdominal aortic aneurysm. (англ.) // European Journal of Vascular and Endovascular Surgery (англ.) (рус. : journal. — 2002. — Vol. 23, no. 5. — P. 421—425. — doi:10.1053/ejvs.2002.1633. — PMID 12027469.
Strausberg R.L., Feingold E.A., Grouse L.H., et al. Generation and initial analysis of more than 15,000 full-length human and mouse cDNA sequences. (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 2003. — Vol. 99, no. 26. — P. 16899—16903. — doi:10.1073/pnas.242603899. — PMID 12477932. — PMC 139241.
Lemos T.A., Passos D.O., Nery F.C., Kobarg J. Characterization of a new family of proteins that interact with the C-terminal region of the chromatin-remodeling factor CHD-3. (англ.) // FEBS Lett. (англ.) (рус. : journal. — 2003. — Vol. 533, no. 1—3. — P. 14—20. — doi:10.1016/S0014-5793(02)03737-7. — PMID 12505151.
Ota T., Suzuki Y., Nishikawa T., et al. Complete sequencing and characterization of 21,243 full-length human cDNAs. (англ.) // Nat. Genet. : journal. — 2004. — Vol. 36, no. 1. — P. 40—5. — doi:10.1038/ng1285. — PMID 14702039.
Gerhard D.S., Wagner L., Feingold E.A., et al. The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). (англ.) // Genome Res. (англ.) (рус. : journal. — 2004. — Vol. 14, no. 10B. — P. 2121—2127. — doi:10.1101/gr.2596504. — PMID 15489334. — PMC 528928.
Otsuki T., Ota T., Nishikawa T., et al. Signal sequence and keyword trap in silico for selection of full-length human cDNAs encoding secretion or membrane proteins from oligo-capped cDNA libraries. (англ.) // DNA Res. (англ.) (рус. : journal. — 2007. — Vol. 12, no. 2. — P. 117—126. — doi:10.1093/dnares/12.2.117. — PMID 16303743.
Lemos T.A., Kobarg J. CGI-55 interacts with nuclear proteins and co-localizes to p80-coilin positive-coiled bodies in the nucleus. (англ.) // Cell Biochem. Biophys. (англ.) (рус. : journal. — 2006. — Vol. 44, no. 3. — P. 463—474. — doi:10.1385/CBB:44:3:463. — PMID 16679534.
Passos D.O., Bressan G.C., Nery F.C., Kobarg J. Ki-1/57 interacts with PRMT1 and is a substrate for arginine methylation. (англ.) // FEBS J. (англ.) (рус. : journal. — 2006. — Vol. 273, no. 17. — P. 3946—3961. — doi:10.1111/j.1742-4658.2006.05399.x. — PMID 16879614.
Dalmáz C.A., Santos K.G., Botton M.R., et al. Relationship between polymorphisms in thrombophilic genes and preeclampsia in a Brazilian population. (англ.) // Blood Cells Mol. Dis. (англ.) (рус. : journal. — 2006. — Vol. 37, no. 2. — P. 107—110. — doi:10.1016/j.bcmd.2006.07.005. — PMID 16963292.
Beausoleil S.A., Villén J., Gerber S.A., et al. A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. (англ.) // Nat. Biotechnol. : journal. — 2006. — Vol. 24, no. 10. — P. 1285—1292. — doi:10.1038/nbt1240. — PMID 16964243.
Olsen J.V., Blagoev B., Gnad F., et al. Global, in vivo, and site-specific phosphorylation dynamics in signaling networks. (англ.) // Cell : journal. — Cell Press, 2006. — Vol. 127, no. 3. — P. 635—648. — doi:10.1016/j.cell.2006.09.026. — PMID 17081983.

[pmid11001948-1] Heaton J.H., Dlakic W.M., Dlakic M., Gelehrter T.D. Identification and cDNA cloning of a novel RNA-binding protein that interacts with the cyclic nucleotide-responsive sequence in the Type-1 plasminogen activator inhibitor mRNA (англ.) // J Biol Chem : journal. — 2001. — May (vol. 276, no. 5). — P. 3341—3347. — doi:10.1074/jbc.M006538200. — PMID 11001948.

[pmid10810093-2] Lai C.H., Chou C.Y., Ch'ang L.Y., Liu C.S., Lin W. Identification of novel human genes evolutionarily conserved in Caenorhabditis elegans by comparative proteomics (англ.) // Genome Res (англ.) (рус. : journal. — 2000. — August (vol. 10, no. 5). — P. 703—713. — doi:10.1101/gr.10.5.703. — PMID 10810093. — PMC 310876.

[entrez-3] Entrez Gene: SERBP1 SERPINE1 mRNA binding protein 1 (неопр.). Архивировано 5 декабря 2010 года.

[pmid12505151-4] Lemos, Taíla A; Passos Dario O; Nery Flávia C; Kobarg Jörg. Characterization of a new family of proteins that interact with the C-terminal region of the chromatin-remodeling factor CHD-3 (англ.) // FEBS Lett. (англ.) (рус. : journal. — Netherlands, 2003. — January (vol. 533, no. 1—3). — P. 14—20. — ISSN 0014-5793. — doi:10.1016/S0014-5793(02)03737-7. — PMID 12505151.

[pmid16169070-5] Stelzl, Ulrich; Worm Uwe, Lalowski Maciej, Haenig Christian, Brembeck Felix H., Goehler Heike, Stroedicke Martin, Zenkner Martina, Schoenherr Anke, Koeppen Susanne, Timm Jan, Mintzlaff Sascha, Abraham Claudia, Bock Nicole, Kietzmann Silvia, Goedde Astrid, Toksöz Engin, Droege Anja, Krobitsch Sylvia, Korn Bernhard, Birchmeier Walter, Lehrach Hans, Wanker Erich E. A human protein-protein interaction network: a resource for annotating the proteome (англ.) // Cell : journal. — United States: Cell Press, 2005. — September (vol. 122, no. 6). — P. 957—968. — ISSN 0092-8674. — doi:10.1016/j.cell.2005.08.029. — PMID 16169070.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]