PHF21A

Пальцевидный белок PHD 21A
Пальцевидный белок PHD 21A
	Представлено на основе PDB 2PUY.
Доступные структуры
PDB
	Список идентификаторов PDB 2PUY, 2YQL
Идентификаторы
Символ
Внешние ID
Функция	• DNA binding; • chromatin binding; • zinc ion binding;
Компонент клетки	• histone deacetylase complex; • nucleoplasm;
Биологический процесс	• negative regulation of transcription from RNA polymerase II promoter; • suckling behavior; • transcription, DNA-templated; • regulation of transcription, DNA-templated; • blood coagulation; • chromatin modification;
	Источники: Amigo / QuickGO
Профиль экспрессии РНК
	Больше информации
Ортологи

Пальцевидный белок PHD 21A — белок, кодируемый у человека геном PHF21A .^[1]^[2]^[3]

ФункцияПравить

PHF21A является составной частью BRAF35 (MIM 605535)/гистондеацетилазы (HDAC, см MIM 601241) комплекса (BHC), являясь посредником репрессии нейроноспецифических генов посредством цис-регуляторных элементов, известный как репрессорный элемент 1 (RE1) или нейронный ограничительный сайленсер (NRS) (Hakimi и др., 2002).^[3]

ВзаимодействияПравить

PHF21A, как было выявлено, взаимодействует с:

ПримечанияПравить

↑ Nagase T., Kikuno R., Hattori A., Kondo Y., Okumura K., Ohara O. Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XIX. The complete sequences of 100 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro (англ.) // DNA Research (англ.) (рус. : journal. — 2000. — February (vol. 7, no. 6). — P. 347—355. — doi:10.1093/dnares/7.6.347. — PMID 11214970.
↑ ¹ ² ³ ⁴ ⁵ Hakimi M.A., Bochar D.A., Chenoweth J., Lane W.S., Mandel G., Shiekhattar R. A core-BRAF35 complex containing histone deacetylase mediates repression of neuronal-specific genes (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 2002. — May (vol. 99, no. 11). — P. 7420—7425. — doi:10.1073/pnas.112008599. — PMID 12032298.
↑ ¹ ² Entrez Gene: PHF21A PHD finger protein 21A (неопр.). Архивировано 5 декабря 2010 года.
↑ ¹ ² ³ ⁴ Iwase S., Januma A., Miyamoto K., Shono N., Honda A., Yanagisawa J., Baba T. Characterization of BHC80 in BRAF-HDAC complex, involved in neuron-specific gene repression (англ.) // Biochemical and Biophysical Research Communications (англ.) (рус. : journal. — 2004. — September (vol. 322, no. 2). — P. 601—608. — doi:10.1016/j.bbrc.2004.07.163. — PMID 15325272.
↑ Hakimi M.A., Dong Y., Lane W.S., Speicher D.W., Shiekhattar R. A candidate X-linked mental retardation gene is a component of a new family of histone deacetylase-containing complexes (англ.) // Journal of Biological Chemistry : journal. — 2003. — February (vol. 278, no. 9). — P. 7234—7239. — doi:10.1074/jbc.M208992200. — PMID 12493763.

ЛитератураПравить

Hakimi M.A., Dong Y., Lane W.S., Speicher D.W., Shiekhattar R. A candidate X-linked mental retardation gene is a component of a new family of histone deacetylase-containing complexes (англ.) // Journal of Biological Chemistry : journal. — 2003. — Vol. 278, no. 9. — P. 7234—7239. — doi:10.1074/jbc.M208992200. — PMID 12493763.
Iwase S., Januma A., Miyamoto K., Shono N., Honda A., Yanagisawa J., Baba T. Characterization of BHC80 in BRAF-HDAC complex, involved in neuron-specific gene repression (англ.) // Biochemical and Biophysical Research Communications (англ.) (рус. : journal. — 2004. — Vol. 322, no. 2. — P. 601—608. — doi:10.1016/j.bbrc.2004.07.163. — PMID 15325272.
Shi Y.J., Matson C., Lan F., Iwase S., Baba T., Shi Y. Regulation of LSD1 histone demethylase activity by its associated factors (англ.) // Molecular Cell (англ.) (рус. : journal. — 2005. — Vol. 19, no. 6. — P. 857—864. — doi:10.1016/j.molcel.2005.08.027. — PMID 16140033.
Rual J.F., Venkatesan K., Hao T., Hirozane-Kishikawa T., Dricot A., Li N., Berriz G.F., Gibbons F.D., Dreze M., Ayivi-Guedehoussou N., Klitgord N., Simon C., Boxem M., Milstein S., Rosenberg J., Goldberg D.S., Zhang L.V., Wong S.L., Franklin G., Li S., Albala J.S., Lim J., Fraughton C., Llamosas E., Cevik S., Bex C., Lamesch P., Sikorski R.S., Vandenhaute J., Zoghbi H.Y., Smolyar A., Bosak S., Sequerra R., Doucette-Stamm L., Cusick M.E., Hill D.E., Roth F.P., Vidal M. Towards a proteome-scale map of the human protein-protein interaction network (англ.) // Nature : journal. — 2005. — Vol. 437, no. 7062. — P. 1173—1178. — doi:10.1038/nature04209. — PMID 16189514.
Hailesellasse Sene K., Porter C.J., Palidwor G., Perez-Iratxeta C., Muro E.M., Campbell P.A., Rudnicki M.A., Andrade-Navarro M.A. Gene function in early mouse embryonic stem cell differentiation (англ.) // BMC Genomics (англ.) (рус. : journal. — 2007. — Vol. 8. — P. 85. — doi:10.1186/1471-2164-8-85. — PMID 17394647.

[pmid11214970-1] Nagase T., Kikuno R., Hattori A., Kondo Y., Okumura K., Ohara O. Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XIX. The complete sequences of 100 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro (англ.) // DNA Research (англ.) (рус. : journal. — 2000. — February (vol. 7, no. 6). — P. 347—355. — doi:10.1093/dnares/7.6.347. — PMID 11214970.

[pmid12032298-2] ¹ ² ³ ⁴ ⁵ Hakimi M.A., Bochar D.A., Chenoweth J., Lane W.S., Mandel G., Shiekhattar R. A core-BRAF35 complex containing histone deacetylase mediates repression of neuronal-specific genes (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 2002. — May (vol. 99, no. 11). — P. 7420—7425. — doi:10.1073/pnas.112008599. — PMID 12032298.

[entrez-3] ¹ ² Entrez Gene: PHF21A PHD finger protein 21A (неопр.). Архивировано 5 декабря 2010 года.

[pmid15325272-4] ¹ ² ³ ⁴ Iwase S., Januma A., Miyamoto K., Shono N., Honda A., Yanagisawa J., Baba T. Characterization of BHC80 in BRAF-HDAC complex, involved in neuron-specific gene repression (англ.) // Biochemical and Biophysical Research Communications (англ.) (рус. : journal. — 2004. — September (vol. 322, no. 2). — P. 601—608. — doi:10.1016/j.bbrc.2004.07.163. — PMID 15325272.

[pmid12493763-5] Hakimi M.A., Dong Y., Lane W.S., Speicher D.W., Shiekhattar R. A candidate X-linked mental retardation gene is a component of a new family of histone deacetylase-containing complexes (англ.) // Journal of Biological Chemistry : journal. — 2003. — February (vol. 278, no. 9). — P. 7234—7239. — doi:10.1074/jbc.M208992200. — PMID 12493763.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]