Это не официальный сайт wikipedia.org 01.01.2023

Herelleviridae — Википедия
Википедия

Herelleviridae

Herelleviridae — семейство вирулентных бактериофагов с миовирусной морфологией.

Herelleviridae
Бактериофаг Schiekvirus EfV12, масштабная черта — 100 нм
Бактериофаг Schiekvirus EfV12,
масштабная черта — 100 нм
Научная классификация
Группа:
Вирусы[1]
Реалм:
Duplodnaviria
Царство:
Heunggongvirae
Тип:
Uroviricota
Класс:
Caudoviricetes
Семейство:
Herelleviridae
Международное научное название
Herelleviridae
Группа по Балтимору
I: дцДНК-вирусы

ИсторияПравить

В 2000-х годах развитие методов геномного анализа позволило выявить гетерогенность классических семейств бактериофагов, выделенных на основе морфологических признаков вирусных частиц[2][3]. В 2009 году Роб Лавин и Эндрю Кропински с соавторами осуществили кластеризацию белковых последовательностей бактериофагов с миовирусной морфологией и предложили подсемейство Spounavirinae в составе семейства Myoviridae. На основании результатов комплексного анализа геномных последовательностей, в 2020 году коллектив авторов в составе Якуба Барыльского, Эвелин Адриансенс и 19 других членов Международного комитета по таксономии вирусов описал сходное по составу семейство Herelleviridae. Названное в честь столетней годовщины открытия вирусов прокариот Феликсом д’Эреллем, оно стало вторым после Ackermannviridae семейством бактериофагов, описанным по результатам биоинформационного анализа общих генов[4][5].

ХарактеристикаПравить

В 2021 году семейство Herelleviridae включало в себя 34 рода бактериофагов. Из них наиболее объёмными были Kayvirus и Pecentumvirus c 11 видами в каждом, а также Bequatrovirus, Caeruleovirus, Harbinvirus и Wphvirus с пятью-шестью видами[6]. Размер капсидов составляет 78—100 нм. Белок хвостовой оболочки состоит из двух или трёх доменов[7]. Размер геномов варьирует в пределах 102—167 т. п. н.[8]. Концы геномов организованы в виде длинных повторов протяжённостью 2—16 т. п. н. Репликация осуществляется при помощи кодируемой геномом фага ДНК-полимеразы. Хозяевами являются бактерии типа Firmicutes[9]. Продолжительность латентного периода в жизненном цикле может составлять от 10 до 50 минут[10][11][12]. Диапазон действия у представителей Kayvirus, инфицирующих Staphylococcus aureus, — от 60% до более чем 95% протестированных изолятов[13]. Schiekvirus EfV12 является примером бактериофага, способного размножаться на культурах двух различных видов энтерококков[14].

Практическое значениеПравить

В 1997—2014 годах представители родов Kayvirus, Kochikohdavirus и Schiekvirus входили в состав препарата Пиобактериофаг института имени Георга Элиавы[15].

ПримечанияПравить

  1. ↑ Таксономия вирусов (англ.) на сайте Международного комитета по таксономии вирусов (ICTV).
  2. ↑ Turner D, Kropinski AM, Adriaenssens EM (2021). “A roadmap for genome-based phage taxonomy”. Viruses. 13 (3): 506. DOI:10.3390/v13030506. PMID 33803862.
  3. ↑ Савич В. В., Сидоренко А. В. Некоторые аспекты современной систематики бактериофагов // Микробные биотехнологии: фундаментальные и прикладные аспекты : Сборник научных трудов. — Минск: Республиканское унитарное предприятие "Издательский дом "Белорусская наука", 2021. — Т. 13. — С. 83–102. — doi:10.47612/2226-3136-2021-13-83-102.
  4. ↑ Lavigne R, Darius P, Summer EJ, Seto D, Mahadevan P, Nilsson AS, Ackermann HW, Kropinski AM (2009). “Classification of Myoviridae bacteriophages using protein sequence similarity”. BMC Microbiology. 9: 224. DOI:10.1186/1471-2180-9-224. PMID 19857251.
  5. ↑ Barylski J, Enault F, Dutilh BE, Schuller MB, Edwards RA, Gillis A, Klumpp J, Knezevic P, Krupovic M, Kuhn JH et al. (2020). “Analysis of spounaviruses as a case study for the overdue reclassification of tailed phages”. Systematic Biology. 69 (1): 110—123. DOI:10.1093/sysbio/syz036. PMID 31127947.
  6. ↑ Virus Taxonomy: 2021 Release  (неопр.). International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV). Дата обращения: 18 января 2023.
  7. ↑ Evseev P, Shneider M, Miroshnikov K (2022). “Evolution of phage tail sheath protein”. Viruses. 14 (6): 1148. DOI:10.3390/v14061148. PMID 35746620.
  8. ↑ [https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/?term=txid2560065[Organism:exp] Nucleotide Database]  (неопр.). National Library of Medicine. Дата обращения: 2023-18-01.
  9. ↑ Barylski J, Kropinski AM, Alikhan NF, Adriaenssens EM, Ictv Report Consortium (2020). “ICTV Virus Taxonomy Profile: Herelleviridae”. The Journal of General Virology. 101 (4): 362—363. DOI:10.1099/jgv.0.001392. PMID 32022658.
  10. ↑ Arroyo-Moreno S, Buttimer C, Bottacini F, Chanishvili N, Ross P, Hill C, Coffey A (2022). “Insights into gene transcriptional regulation of Kayvirus bacteriophages obtained from therapeutic mixtures”. Viruses. 14 (3): 626. DOI:10.3390/v14030626. PMID 35337034.
  11. ↑ Liu S, Hon K, Bouras GS, Psaltis AJ, Shearwin K, Wormald PJ, Vreugde S (2022). “APTC-C-SA01: A novel bacteriophage cocktail targeting Staphylococcus aureus and MRSA biofilms”. International Journal of Molecular Sciences. 23 (11): 6116. DOI:10.3390/ijms23116116. PMID 35682794.
  12. ↑ Tkachev PV, Pchelin IM, Azarov DV, Gorshkov AN, Shamova OV, Dmitriev AV, Goncharov AE (2022). “Two novel lytic bacteriophages infecting Enterococcus spp. are promising candidates for targeted antibacterial therapy”. Viruses. 14 (4): 831. DOI:10.3390/v14040831. PMID 35458561.
  13. ↑ McCallin S, Sarker SA, Sultana S, Oechslin F, Brussow H (2018). “Metagenome analysis of Russian and Georgian Pyophage cocktails and a placebo-controlled safety trial of single phage versus phage cocktail in healthy Staphylococcus aureus carriers”. Environmental Microbiology. 20 (9): 3278—3293. DOI:10.1111/1462-2920.14310. PMID 30051571.
  14. ↑ Wandro S, Oliver A, Gallagher T, Weihe C, England W, Martiny JBH, Whiteson K (2019). “Predictable molecular adaptation of coevolving Enterococcus faecium and lytic phage EfV12-phi1”. Frontiers in Microbiology. 9: 3192. DOI:10.3389/fmicb.2018.03192. PMID 30766528.
  15. ↑ Villarroel J, Larsen MV, Kilstrup M, Nielsen M (2017). “Metagenomic analysis of therapeutic PYO phage cocktails from 1997 to 2014”. Viruses. 9 (11): 328. DOI:10.3390/v9110328. PMID 29099783.
Источник — https://ru.wikipedia.org/w/index.php?title=Herelleviridae&oldid=128999862