Faustovirus

*Faustovirus*
Faustovirus
	; Реконструкция вириона Faustovirus с помощью криоэлектронной микроскопии
Научная классификация
	Группа: Вирусы Реалм: incertae sedis Вид: Faustovirus
Международное научное название
	Faustovirus
Группа по Балтимору
	I: дцДНК-вирусы
NCBI	1477405

Faustovirus (лат.) — гигантский вирус, который морфологически и генетически близок к двум другим гигантским вирусам, Pacmanvirus и Kaumoebavirus, а также вирусам семейства Asfarviridae. Faustovirus был выделен в 2015 году из протиста Vermamoeba vermiformis^[3].

По состоянию на ноябрь 2018 года род Faustovirus не зарегистрирован в базе данных Международного комитета по таксономии вирусов (ICTV)^[4].

ОписаниеПравить

Faustovirus имеет икосаэдрические вирионы размером около 200 нм^[3]. В 2016 году вирионы Faustovirus были детально изучены с помощью криоэлектронной микроскопии. Мажорный белок капсида (англ. major capsid protein, MCP) внешней оболочки этого вируса формирует тримеры^[en], каждый мономер которого состоит из двух расположенных друг за другом структурных мотивов jelly roll^[en]. Один мотив jelly roll включает 8 бета-листов. Подобная организация мажорного белка капсида встречается у многих вирусов. Капсомер представлен гексамером MCP и достигает около 75 Å в диаметре. В отличие от большинства других гигантских вирусов, у Faustovirus есть и второй, внутренний слой капсида, также образованный белковыми гексамерами^[5].

ГеномПравить

Геном Faustovirus представлен кольцевой двуцепочечной молекулой ДНК из 466265 пар оснований (п. о.). GC-состав генома равен 36 %. В геноме находятся 451 белок-кодирующих гена, длины их продуктов находятся в промежутке от 47 до 2980 аминокислотных остатков (а. о.). Генов, кодирующих тРНК, в геноме Faustovirus не выявлено. Только для 31 % белков Faustovirus нашлись гомологи в базах данных. Больше всего белков Faustovirus гомологичны белкам Asfarviridae; также имеются белки, родственные белкам вирусов семейств Phycodnaviridae^[en], Mimiviridae^[en], Marseilleviridae^[en] и Ascoviridae^[en]. Некоторые белки родственны белкам бактериофагов, кроме того, ряд белков имеют родственников только среди клеточных организмов: эукариот, бактерий и архей. В генах, кодирующих белки капсида, выявлено множество интронов^[5], в числе которых 6 самосплайсирующихся интронов I группы^[en] — очень нетипичный для вирусов случай^[3].

Жизненный циклПравить

Заражение клеток Vermamoeba vermiformis начинается с фагоцитоза протистом вирусных частиц. Через 2—4 часа после инфицирования вирионы выявляются внутри фагосом, некоторые из которых могут находиться даже вблизи клеточного ядра, хотя взаимодействия вирусных частиц с ядром обнаружено не было. Далее фагосомы выпускают своё содержимое в цитоплазму клетки-хозяина: внутренняя мембрана вируса сливается с мембраной фагосомы, и содержимое вириона выходит наружу, подобно тому, как это происходит у мимивируса. После этого часть вирионов перестаёт быть видимыми. Выход белков и ДНК Faustovirus в клетку происходит через 4—6 часов после заражения. Любопытно, что параллельно ядро клетки-хозяина претерпевает некоторую реогранизацию, а именно, оно утрачивает сферическую форму. Через 8—10 часов после инфицирования клетка округляется и теряет связь с субстратом, а в цитоплазме становится отчётливо видна вирусная фабрика, содержащая новообразованные вирусные частицы и окружённая митохондриями. У некоторых клеток в вирусных фабриках находятся только лишь пустые капсиды. Через 12—14 часов после заражения вирусная фабрика занимает уже практически всё свободное пространство в клетке, а через 18—20 часов происходит лизис большинства клеток и выход наружу новых вирионов^[3].

Филогения и родственные связиПравить

Согласно филогенетическому дереву, построенному на основании последовательности генов семейства^[en] ДНК-полимеразы B, Pacmanvirus, Kaumoebavirus, Faustovirus и Asfarviridae формируют монофилетическую кладу. По-видимому, эти вирусы имели общего предка. Последовательность локуса, кодирующего мажорный белок капсида (англ. major capsid protein), сближает Pacmanvirus с Asfarviridae, однако архитектура вириона ближе к таковой у Faustovirus^[6].

ПримечанияПравить

↑ Таксон не признан Международным комитетом по таксономии вирусов (ICTV).
↑ Таксономия вирусов (англ.) на сайте Международного комитета по таксономии вирусов (ICTV).
↑ ¹ ² ³ ⁴ Reteno D. G., Benamar S., Khalil J. B., Andreani J., Armstrong N., Klose T., Rossmann M., Colson P., Raoult D., La Scola B. Faustovirus, an asfarvirus-related new lineage of giant viruses infecting amoebae. (англ.) // Journal Of Virology. — 2015. — July (vol. 89, no. 13). — P. 6585—6594. — doi:10.1128/JVI.00115-15. — PMID 25878099. [исправить]
↑ Search Faustovirus in ICTV database (неопр.). Дата обращения: 11 ноября 2018. Архивировано из оригинала 4 октября 2013 года.
↑ ¹ ² Klose T., Reteno D. G., Benamar S., Hollerbach A., Colson P., La Scola B., Rossmann M. G. Structure of faustovirus, a large dsDNA virus. (англ.) // Proceedings Of The National Academy Of Sciences Of The United States Of America. — 2016. — 31 May (vol. 113, no. 22). — P. 6206—6211. — doi:10.1073/pnas.1523999113. — PMID 27185929. [исправить]
↑ Andreani J., Khalil J. Y. B., Sevvana M., Benamar S., Di Pinto F., Bitam I., Colson P., Klose T., Rossmann M. G., Raoult D., La Scola B. Pacmanvirus, a New Giant Icosahedral Virus at the Crossroads between Asfarviridae and Faustoviruses. (англ.) // Journal Of Virology. — 2017. — 15 July (vol. 91, no. 14). — doi:10.1128/JVI.00212-17. — PMID 28446673. [исправить]

[1] Таксон не признан Международным комитетом по таксономии вирусов (ICTV).

[2] Таксономия вирусов (англ.) на сайте Международного комитета по таксономии вирусов (ICTV).

[:1-3] ¹ ² ³ ⁴ Reteno D. G., Benamar S., Khalil J. B., Andreani J., Armstrong N., Klose T., Rossmann M., Colson P., Raoult D., La Scola B. Faustovirus, an asfarvirus-related new lineage of giant viruses infecting amoebae. (англ.) // Journal Of Virology. — 2015. — July (vol. 89, no. 13). — P. 6585—6594. — doi:10.1128/JVI.00115-15. — PMID 25878099. [исправить]

[4] Search Faustovirus in ICTV database (неопр.). Дата обращения: 11 ноября 2018. Архивировано из оригинала 4 октября 2013 года.

[:2-5] ¹ ² Klose T., Reteno D. G., Benamar S., Hollerbach A., Colson P., La Scola B., Rossmann M. G. Structure of faustovirus, a large dsDNA virus. (англ.) // Proceedings Of The National Academy Of Sciences Of The United States Of America. — 2016. — 31 May (vol. 113, no. 22). — P. 6206—6211. — doi:10.1073/pnas.1523999113. — PMID 27185929. [исправить]

[Pac-6] Andreani J., Khalil J. Y. B., Sevvana M., Benamar S., Di Pinto F., Bitam I., Colson P., Klose T., Rossmann M. G., Raoult D., La Scola B. Pacmanvirus, a New Giant Icosahedral Virus at the Crossroads between Asfarviridae and Faustoviruses. (англ.) // Journal Of Virology. — 2017. — 15 July (vol. 91, no. 14). — doi:10.1128/JVI.00212-17. — PMID 28446673. [исправить]

[3]

[2]

[1]

[4]

[5]

[6]