ETS1

ETS1
Доступные структуры
PDB	Поиск ортологов: PDBe RCSB
List of PDB id codes
	1GVJ, 2NNY, 2STT, 2STW, 3MFK, 3RI4, 3WTS, 3WTT, 3WTU, 3WTV, 3WTW, 3WTX, 3WTY, 3WTZ, 3WU0, 3WU1, 4L0Y, 4L0Z, 4L18, 4LG0
Идентификаторы
Символы	ETS1, ETS-1, EWSR2, p54, c-ets-1, ETS proto-oncogene 1, transcription factor
Внешние IDs	OMIM: 164720 MGI: 95455 HomoloGene: 3837 GeneCards: ETS1
Расположение гена (человек)
Хр.	11-я хромосома человека
Конец	128,587,558 bp
Расположение гена (мышь)
Хр.	Chromosome 9 (mouse)
Конец	32,757,820 bp
Паттерн экспрессии РНК
	Top expressed in
	visceral pleura; ; parietal pleura; ; lower lobe of lung; ; germinal epithelium;
	Top expressed in
	left lung lobe; ; right lung lobe; ; endocardial cushion; ; body of femur;
	More reference expression data
	More reference expression data
Генная онтология
Функции	ДНК-связывающий; sequence-specific DNA binding; DNA-binding transcription factor activity; transcription factor binding; связывание с белками плазмы; связывание похожих белков; transcription factor activity, RNA polymerase II core promoter proximal region sequence-specific binding; RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding; DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific; sequence-specific double-stranded DNA binding; DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific; histone acetyltransferase binding;
Компонент клетки	цитоплазма; transcription regulator complex; нуклеоплазма; клеточное ядро;
Биологический процесс	regulation of apoptotic process; развитие гипофиза; response to estradiol; response to interleukin-1; response to hypoxia; ДНК-зависимая регуляция транскрипции; positive regulation of erythrocyte differentiation; движение клеток; эструс; immune system process; regulation of transcription by RNA polymerase II; response to antibiotic; женская беременность; angiogenesis involved in wound healing; positive regulation of cell migration; response to mechanical stimulus; response to laminar fluid shear stress; negative regulation of cell cycle; regulation of angiogenesis; transcription by RNA polymerase II; regulation of extracellular matrix disassembly; транскрипция, ДНК-зависимая; positive regulation of endothelial cell migration; ДНК-зависимая позитивная регуляция транскрипции; PML body organization; response to wounding; иммунный ответ; позитивная регуляция пролиферации клеток; hypothalamus development; negative regulation of inflammatory response; положительная регуляция транскрипции РНК полимеразой II промотор; негативная регуляция пролиферации клеток; cellular response to hydrogen peroxide; positive regulation of inflammatory response; pri-miRNA transcription by RNA polymerase II; positive regulation of leukocyte adhesion to vascular endothelial cell; positive regulation of gene expression; positive regulation of blood vessel endothelial cell migration; positive regulation of angiogenesis; Дифференцировка клеток;
	Sources:Amigo / QuickGO
Ортологи
	2113
	23871
	ENSG00000134954
	ENSMUSG00000032035
	P14921
	P27577
	NM_001143820; NM_001162422; NM_005238; NM_001330451
	NM_001038642; NM_011808
	NP_001137292; NP_001155894; NP_001317380; NP_005229
NP_001033731; NP_035938; NP_001359463; NP_001359464; NP_001359465;
	NP_001359466
	Викиданные
Править (человек)	Править (мышь)

Белок C-ets-1 (англ. Protein C-ets-1) — белок фактор транскрипции, продукт гена человека ETS1^[5]. Входит в семейство факторов транскрипции ETS^[6].

ФункцииПравить

Фактор трансккрипции, который осуществляет прямой контроль экспрессии цитокинов и хемокинов в ходе множества клеточных процессов. Может контролировать дифференцировку, выживание и пролиферацию клеток лимфоидного ряда. Может регулировать ангиогенез за счёт регулирования экспрессии генов, отвечающих за миграцию и инвазию клеток.

ВзаимодействияПравить

Ets1 взаимодействует с рядом других факторов транскрипции, образуя мультимолекулярные комплексы. При взаимодействии Ets1 с другими факторами транскрипции (Runx1, Pax5, TFE3, USF1) конечный эффект комплекса зависит от статуса фосфорилирования C-концевого домена Ets1 (фосфорилирование инактивирует его). Ацетилтрансферазы CBP и p300 связывают Ets1. трансактивационный домен. AP1, STAT5 и VDR связываются с C-концевым доменом белка.

Кроме этого, Ets1 связывается с TTRAP,^[7] UBE2I^[8] и DAXX.^[9]

Структура и внутриклеточная локализацияПравить

Белок C-ets-1 состоит из 441 аминокислоты, молекулярная масса 50,4 кДа. Локализован в клеточном ядре, может переходить в цитоплазму при связывании изоформы Ets-1 p27.

ЭкспрессияПравить

Наиболее высокий уровеь экспрессии обнаружен в клетках лимфоидного ряда. Изоформы c-ETS-1A и Ets-1 p27 обнаружены во всех фетальных тканях. В тканях взрослого организма уровень может сильно различаться, отсутствует в мозге и почках.

ПримечанияПравить

↑ ¹ ² ³ GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000134954 - Ensembl, May 2017
↑ ¹ ² ³ GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000032035 - Ensembl, May 2017
↑ Human PubMed Reference: (неопр.) National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
↑ Mouse PubMed Reference: (неопр.) National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
↑ Delattre O., Zucman J., Plougastel B., Desmaze C., Melot T., Peter M., Kovar H., Joubert I., de Jong P., Rouleau G. Gene fusion with an ETS DNA-binding domain caused by chromosome translocation in human tumours (англ.) // Nature : journal. — 1992. — September (vol. 359, no. 6391). — P. 162—165. — doi:10.1038/359162a0. — PMID 1522903.
↑ Dwyer J., Li H., Xu D., Liu J. P. Transcriptional regulation of telomerase activity: roles of the Ets transcription factor family (англ.) // Annals of the New York Academy of Sciences (англ.) (рус. : journal. — 2007. — October (vol. 1114, no. 1). — P. 36—47. — doi:10.1196/annals.1396.022. — PMID 17986575.
↑ Pei H., Yordy J. S., Leng Q., Zhao Q., Watson D. K., Li R. EAPII interacts with ETS1 and modulates its transcriptional function (англ.) // Oncogene (англ.) (рус. : journal. — 2003. — May (vol. 22, no. 18). — P. 2699—2709. — doi:10.1038/sj.onc.1206374. — PMID 12743594.
↑ Hahn S. L., Wasylyk B., Criqui-Filipe P., Criqui P. Modulation of ETS-1 transcriptional activity by huUBC9, a ubiquitin-conjugating enzyme (англ.) // Oncogene (англ.) (рус. : journal. — 1997. — September (vol. 15, no. 12). — P. 1489—1495. — doi:10.1038/sj.onc.1201301. — PMID 9333025.
↑ Li R., Pei H., Watson D. K., Papas T. S. EAP1/Daxx interacts with ETS1 and represses transcriptional activation of ETS1 target genes (англ.) // Oncogene (англ.) (рус. : journal. — 2000. — February (vol. 19, no. 6). — P. 745—753. — doi:10.1038/sj.onc.1203385. — PMID 10698492.

ЛитератураПравить

Bonaldo M. F., Lennon G., Soares M. B. Normalization and subtraction: two approaches to facilitate gene discovery (англ.) // Genome Res. (англ.) (рус. : journal. — 1997. — Vol. 6, no. 9. — P. 791—806. — doi:10.1101/gr.6.9.791. — PMID 8889548.
Nishihara S., Iwasaki H., Kaneko M. et al. Alpha1,3-fucosyltransferase 9 (FUT9; Fuc-TIX) preferentially fucosylates the distal GlcNAc residue of polylactosamine chain while the other four alpha1,3FUT members preferentially fucosylate the inner GlcNAc residue (англ.) // FEBS Lett. (англ.) (рус. : journal. — 2000. — Vol. 462, no. 3. — P. 289—294. — doi:10.1016/S0014-5793(99)01549-5. — PMID 10622713.
Cailleau-Thomas A., Coullin P., Candelier J. J. et al. FUT4 and FUT9 genes are expressed early in human embryogenesis (англ.) // Glycobiology : journal. — 2000. — Vol. 10, no. 8. — P. 789—802. — doi:10.1093/glycob/10.8.789. — PMID 10929005.
Nakayama F., Nishihara S., Iwasaki H. et al. CD15 expression in mature granulocytes is determined by alpha 1,3-fucosyltransferase IX, but in promyelocytes and monocytes by alpha 1,3-fucosyltransferase IV (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 2001. — Vol. 276, no. 19. — P. 16100—16106. — doi:10.1074/jbc.M007272200. — PMID 11278338.
Roos C., Kolmer M., Mattila P., Renkonen R. Composition of Drosophila melanogaster proteome involved in fucosylated glycan metabolism (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 2002. — Vol. 277, no. 5. — P. 3168—3175. — doi:10.1074/jbc.M107927200. — PMID 11698403.
Toivonen S., Nishihara S., Narimatsu H. et al. Fuc-TIX: a versatile alpha1,3-fucosyltransferase with a distinct acceptor- and site-specificity profile (англ.) // Glycobiology : journal. — 2003. — Vol. 12, no. 6. — P. 361—368. — doi:10.1093/glycob/12.6.361. — PMID 12107078.
Li H., Kong Y., Yan B. [Regulation by ovarian hormones of alpha 1,3-fucosyltransferase gene (FUT9) expression in human endometrium] (англ.) // Sheng Wu Hua Xue Yu Sheng Wu Wu Li Xue Bao : journal. — 2003. — Vol. 34, no. 6. — P. 775—779. — PMID 12417923.
Strausberg R. L., Feingold E. A., Grouse L. H. et al. Generation and initial analysis of more than 15,000 full-length human and mouse cDNA sequences (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 2003. — Vol. 99, no. 26. — P. 16899—16903. — doi:10.1073/pnas.242603899. — PMID 12477932.
Nishihara S., Iwasaki H., Nakajima K. et al. Alpha1,3-fucosyltransferase IX (Fut9) determines Lewis X expression in brain (неопр.) // Glycobiology. — 2004. — Т. 13, № 6. — С. 445—455. — doi:10.1093/glycob/cwg048. — PMID 12626397.
Mungall A. J., Palmer S. A., Sims S. K. et al. The DNA sequence and analysis of human chromosome 6 (англ.) // Nature : journal. — 2003. — Vol. 425, no. 6960. — P. 805—811. — doi:10.1038/nature02055. — PMID 14574404.
Gerhard D. S., Wagner L., Feingold E. A. et al. The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC) (англ.) // Genome Res. (англ.) (рус. : journal. — 2004. — Vol. 14, no. 10B. — P. 2121—2127. — doi:10.1101/gr.2596504. — PMID 15489334.
Bogoevska V., Horst A., Klampe B. et al. CEACAM1, an adhesion molecule of human granulocytes, is fucosylated by fucosyltransferase IX and interacts with DC-SIGN of dendritic cells via Lewis x residues (англ.) // Glycobiology : journal. — 2006. — Vol. 16, no. 3. — P. 197—209. — doi:10.1093/glycob/cwj057. — PMID 16282604.

[refGRCh38Ensembl-1] ¹ ² ³ GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000134954 - Ensembl, May 2017

[refGRCm38Ensembl-2] ¹ ² ³ GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000032035 - Ensembl, May 2017

[3] Human PubMed Reference: (неопр.) National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.

[4] Mouse PubMed Reference: (неопр.) National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.

[pmid1522903-5] Delattre O., Zucman J., Plougastel B., Desmaze C., Melot T., Peter M., Kovar H., Joubert I., de Jong P., Rouleau G. Gene fusion with an ETS DNA-binding domain caused by chromosome translocation in human tumours (англ.) // Nature : journal. — 1992. — September (vol. 359, no. 6391). — P. 162—165. — doi:10.1038/359162a0. — PMID 1522903.

[pmid17986575-6] Dwyer J., Li H., Xu D., Liu J. P. Transcriptional regulation of telomerase activity: roles of the Ets transcription factor family (англ.) // Annals of the New York Academy of Sciences (англ.) (рус. : journal. — 2007. — October (vol. 1114, no. 1). — P. 36—47. — doi:10.1196/annals.1396.022. — PMID 17986575.

[pmid12743594-7] Pei H., Yordy J. S., Leng Q., Zhao Q., Watson D. K., Li R. EAPII interacts with ETS1 and modulates its transcriptional function (англ.) // Oncogene (англ.) (рус. : journal. — 2003. — May (vol. 22, no. 18). — P. 2699—2709. — doi:10.1038/sj.onc.1206374. — PMID 12743594.

[pmid9333025-8] Hahn S. L., Wasylyk B., Criqui-Filipe P., Criqui P. Modulation of ETS-1 transcriptional activity by huUBC9, a ubiquitin-conjugating enzyme (англ.) // Oncogene (англ.) (рус. : journal. — 1997. — September (vol. 15, no. 12). — P. 1489—1495. — doi:10.1038/sj.onc.1201301. — PMID 9333025.

[pmid10698492-9] Li R., Pei H., Watson D. K., Papas T. S. EAP1/Daxx interacts with ETS1 and represses transcriptional activation of ETS1 target genes (англ.) // Oncogene (англ.) (рус. : journal. — 2000. — February (vol. 19, no. 6). — P. 745—753. — doi:10.1038/sj.onc.1203385. — PMID 10698492.

[5]

[6]

[1]

[2]

[3]

[4]

[7]

[8]

[9]