AIM2

AIM2
Доступные структуры
PDB	Поиск ортологов: PDBe RCSB
List of PDB id codes
	3RN2, 3RN5, 3VD8, 4O7Q
Идентификаторы
Символы	AIM2, PYHIN4, absent in melanoma 2
Внешние IDs	OMIM: 604578 MGI: 2686159 HomoloGene: 83226 GeneCards: AIM2
Расположение гена (человек)
Хр.	1-я хромосома человека
Конец	159,187,843 bp
Расположение гена (мышь)
Хр.	Chromosome 1 (mouse)
Конец	173,466,040 bp
Паттерн экспрессии РНК
	n/a
	Top expressed in
	left colon; ; medial geniculate nucleus; ; median eminence; ; dorsomedial hypothalamic nucleus;
	More reference expression data
Генная онтология
Функции	ДНК-связывающий; связывание с белками плазмы; связывание похожих белков; double-stranded DNA binding;
Компонент клетки	цитоплазма; AIM2 inflammasome complex; клеточное ядро; нуклеоплазма; митохондрия; цитозоль;
Биологический процесс	positive regulation of cysteine-type endopeptidase activity; Пироптоз; cellular response to interferon-beta; immune system process; tumor necrosis factor-mediated signaling pathway; positive regulation of NF-kappaB transcription factor activity; иммунный ответ; positive regulation of interleukin-1 beta production; positive regulation of protein oligomerization; activation of innate immune response; воспалительная реакция; negative regulation of NF-kappaB transcription factor activity; positive regulation of defense response to virus by host; апоптоз; Врождённый иммунитет;
	Sources:Amigo / QuickGO
Ортологи
	9447
	383619
	ENSG00000163568
	ENSMUSG00000037860
	O14862
	Q91VJ1
	NM_004833; NM_001348247
	NM_001013779
	NP_004824; NP_001335176
	NP_001013801
	Викиданные
Править (человек)	Править (мышь)

AIM2 (от англ. absent in melanoma 2) — белок, участвует в регуляции иммунного ответа. Продукт гена человека AIM2.^[5]^[6]

Белок входит в особый тип инфламмосом, распознающих инородную бактериальную или вирусную ДНК.^[7]

ФункцииПравить

Белок входит в семейство цитокинов Ifi202/IFI16, содержащих HIN-200 домен. Экспрессия AIM2 индуцируется интерфероном-гамма.^[6]

AIM2 способен к образования особого типа инфламмасом, называемые также ДНК-инфламмасомы по их способности распознавать инородную ДНК за счёт HIN200 домена, который связывает ДНК, и PYD домена, который рекрутирует адаптерный белок ASC, необходимый для формирования инфламмасомы. Олигомеризация комплекса происходит в присутствии бактериальной либо вирусной ДНК, а также собственной повреждённой ДНК. Последнее приводит в результате к аутоиммунной реакции. ASC содержит CARD домен (англ. caspase activation and recruitment domain), который, в свою очередь, рекрутирует прокаспазу-1, что приводит к самоактивации каспазы-1. Активированная каспаза-1 процессирует в активную форму воспалительные цитокины интелейкин-1 бета и интерлейкин-18.^[7]

СтруктураПравить

Белок AIM2 состоит из 343 аминокислот. Содержит N-терминальный пириновый домен DAPIN (участок 1-87) и C-терминальный HIN-200 домен (участок 138-337), который включает 2 фрагмента, способных связывать олигонуклеотиды.^[8]

Клиническое значениеПравить

Повышенный уровень белка AIM2 обнаружен в коже больных псориазом.^[9]

ПримечанияПравить

↑ ¹ ² ³ GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000163568 - Ensembl, May 2017
↑ ¹ ² ³ GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000037860 - Ensembl, May 2017
↑ Human PubMed Reference: (неопр.) National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
↑ Mouse PubMed Reference: (неопр.) National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
↑ DeYoung K. L., Ray M. E., Su Y. A., Anzick S. L., Johnstone R. W., Trapani J. A., Meltzer P. S., Trent J. M. Cloning a novel member of the human interferon-inducible gene family associated with control of tumorigenicity in a model of human melanoma (англ.) // Oncogene (англ.) (рус. : journal. — 1997. — August (vol. 15, no. 4). — P. 453—457. — doi:10.1038/sj.onc.1201206. — PMID 9242382.
↑ ¹ ² Entrez Gene: AIM2 absent in melanoma 2 (неопр.). Архивировано 8 марта 2010 года.
↑ ¹ ² Schroder K., Tschopp J. The inflammasomes (англ.) // Cell. — Cell Press, 2010. — March (vol. 140, no. 6). — P. 821—832. — doi:10.1016/j.cell.2010.01.040. — PMID 20303873.
↑ Fernandes-Alnemri T., Yu J. W., Datta P., Wu J., Alnemri E. S. AIM2 activates the inflammasome and cell death in response to cytoplasmic DNA (англ.) // Nature : journal. — 2009. — March (vol. 458, no. 7237). — P. 509—513. — doi:10.1038/nature07710. — PMID 19158676.
↑ Dombrowski, Y; Peric, M., Koglin, S., Kammerbauer, C., Göß, C., Anz, D., Simanski, M., Gläser, R., Harder, J., Hornung, V., Gallo, R. L., Ruzicka, T., Besch, R., Schauber, J. Cytosolic DNA Triggers Inflammasome Activation in Keratinocytes in Psoriatic Lesions (англ.) // Science translational medicine : journal. — 2011. — 11 May (vol. 3, no. 82). — P. 82ra38—82ra38. — doi:10.1126/scitranslmed.3002001. — PMID 21562230.

ЛитератураПравить

Landolfo S., Gariglio M., Gribaudo G., Lembo D. The Ifi 200 genes: an emerging family of IFN-inducible genes (англ.) // Biochimie (англ.) (рус. : journal. — 1999. — Vol. 80, no. 8—9. — P. 721—728. — doi:10.1016/S0300-9084(99)80025-X. — PMID 9865494.
Woerner SM; Kloor M; Schwitalle Y; Youmans, Hanni; Doeberitz, Magnus von Knebel; Gebert, Johannes; Dihlmann, Susanne. The putative tumor suppressor AIM2 is frequently affected by different genetic alterations in microsatellite unstable colon cancers (англ.) // Genes Chromosomes Cancer (англ.) (рус. : journal. — 2007. — Vol. 46, no. 12. — P. 1080—1089. — doi:10.1002/gcc.20493. — PMID 17726700.
Gregory SG; Barlow KF; McLay KE; Kaul, R.; Swarbreck, D.; Dunham, A.; Scott, C. E.; Howe, K. L.; Woodfine, K. The DNA sequence and biological annotation of human chromosome 1 (англ.) // Nature : journal. — 2006. — Vol. 441, no. 7091. — P. 315—321. — doi:10.1038/nature04727. — PMID 16710414.
Chen IF; Ou-Yang F; Hung JY; Liu, JC; Wang, H; Wang, SC; Hou, MF; Hortobagyi, GN; Hung, M. C. AIM2 suppresses human breast cancer cell proliferation in vitro and mammary tumor growth in a mouse model (англ.) // Mol. Cancer Ther. : journal. — 2006. — Vol. 5, no. 1. — P. 1—7. — doi:10.1158/1535-7163.MCT-05-0310. — PMID 16432157.
Cresswell KS; Clarke CJ; Jackson JT; Darcy, Phillip K.; Trapani, Joseph A.; Johnstone, Ricky W. Biochemical and growth regulatory activities of the HIN-200 family member and putative tumor suppressor protein, AIM2 (англ.) // Biochem. Biophys. Res. Commun. (англ.) (рус. : journal. — 2005. — Vol. 326, no. 2. — P. 417—424. — doi:10.1016/j.bbrc.2004.11.048. — PMID 15582594.
Liu G; Yu JS; Zeng G; Yin, Dong; Xie, Dong; Black, Keith L.; Ying, Han. AIM-2: a novel tumor antigen is expressed and presented by human glioma cells (англ.) // J. Immunother. : journal. — 2004. — Vol. 27, no. 3. — P. 220—226. — doi:10.1097/00002371-200405000-00006. — PMID 15076139.
Strausberg RL; Feingold EA; Grouse LH; Derge, JG; Klausner, RD; Collins, FS; Wagner, L; Shenmen, CM; Schuler, G. D. Generation and initial analysis of more than 15,000 full-length human and mouse cDNA sequences (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 2003. — Vol. 99, no. 26. — P. 16899—16903. — doi:10.1073/pnas.242603899. — PMID 12477932.
Choubey D., Walter S., Geng Y., Xin H. Cytoplasmic localization of the interferon-inducible protein that is encoded by the AIM2 (absent in melanoma) gene from the 200-gene family (англ.) // FEBS Lett. (англ.) (рус. : journal. — 2000. — Vol. 474, no. 1. — P. 38—42. — doi:10.1016/S0014-5793(00)01571-4. — PMID 10828447.

[refGRCh38Ensembl-1] ¹ ² ³ GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000163568 - Ensembl, May 2017

[refGRCm38Ensembl-2] ¹ ² ³ GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000037860 - Ensembl, May 2017

[3] Human PubMed Reference: (неопр.) National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.

[4] Mouse PubMed Reference: (неопр.) National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.

[pmid9242382-5] DeYoung K. L., Ray M. E., Su Y. A., Anzick S. L., Johnstone R. W., Trapani J. A., Meltzer P. S., Trent J. M. Cloning a novel member of the human interferon-inducible gene family associated with control of tumorigenicity in a model of human melanoma (англ.) // Oncogene (англ.) (рус. : journal. — 1997. — August (vol. 15, no. 4). — P. 453—457. — doi:10.1038/sj.onc.1201206. — PMID 9242382.

[entrez-6] ¹ ² Entrez Gene: AIM2 absent in melanoma 2 (неопр.). Архивировано 8 марта 2010 года.

[pmid20303873-7] ¹ ² Schroder K., Tschopp J. The inflammasomes (англ.) // Cell. — Cell Press, 2010. — March (vol. 140, no. 6). — P. 821—832. — doi:10.1016/j.cell.2010.01.040. — PMID 20303873.

[pmid19158676-8] Fernandes-Alnemri T., Yu J. W., Datta P., Wu J., Alnemri E. S. AIM2 activates the inflammasome and cell death in response to cytoplasmic DNA (англ.) // Nature : journal. — 2009. — March (vol. 458, no. 7237). — P. 509—513. — doi:10.1038/nature07710. — PMID 19158676.

[pmid21562230-9] Dombrowski, Y; Peric, M., Koglin, S., Kammerbauer, C., Göß, C., Anz, D., Simanski, M., Gläser, R., Harder, J., Hornung, V., Gallo, R. L., Ruzicka, T., Besch, R., Schauber, J. Cytosolic DNA Triggers Inflammasome Activation in Keratinocytes in Psoriatic Lesions (англ.) // Science translational medicine : journal. — 2011. — 11 May (vol. 3, no. 82). — P. 82ra38—82ra38. — doi:10.1126/scitranslmed.3002001. — PMID 21562230.

[5]

[6]

[1]

[2]

[3]

[4]

[7]

[8]

[9]