40S рибосомный белок S28

RPS28
Доступные структуры
PDB	Поиск ортологов: PDBe RCSB
List of PDB id codes
	4UG0, 4V6X, 5A2Q, 5AJ0, 3J7P, 4KZX, 4UJE, 4KZY, 4D5L, 4KZZ, 3J7R, 4UJD, 5FLX, 4D61, 4UJC
Идентификаторы
Символы	RPS28, S28, DBA15, ribosomal protein S28, eS28
Внешние IDs	OMIM: 603685 MGI: 1859516 HomoloGene: 68150 GeneCards: RPS28
Расположение гена (человек)
Хр.	19-я хромосома человека
Конец	8,323,340 bp
Расположение гена (мышь)
Хр.	Chromosome 17 (mouse)
Конец	34,043,536 bp
Паттерн экспрессии РНК
	Top expressed in
	stromal cell of endometrium; ; skin of abdomen; ; right uterine tube; ; body of pancreas; ; right lobe of thyroid gland; ; left lobe of thyroid gland; ; body of stomach; ; minor salivary gland;
	n/a
	More reference expression data
	n/a
Генная онтология
Функции	structural constituent of ribosome; связывание с белками плазмы; RNA binding;
Компонент клетки	цитозоль; Рибосома; внутренний компонент клетки; small ribosomal subunit; экзосома; нуклеоплазма; cytosolic small ribosomal subunit; цитоплазма; Эндоплазматический ретикулум; шероховатый эндоплазматический ретикулум; polysomal ribosome; cytoplasmic side of rough endoplasmic reticulum membrane;
Биологический процесс	ribosome biogenesis; viral transcription; SRP-dependent cotranslational protein targeting to membrane; translational initiation; нонсенс-опосредованный распад; ribosomal small subunit biogenesis; ribosomal small subunit assembly; maturation of SSU-rRNA; Биосинтез белка; rRNA processing; cytoplasmic translation;
	Sources:Amigo / QuickGO
Ортологи
	6234
	54127
	ENSG00000233927
	ENSMUSG00000067288
	P62857
	P62858
	NM_001031
	NM_016844; NM_001355384
	NP_001022
	NP_058540; NP_001342313
	Викиданные
Править (человек)	Править (мышь)

40S рибосомальный белок S28 (англ. 40S ribosomal protein S28; RPS28)) — рибосомальный белок, продукт гена человека RPS28^[5]^[6]^[7].

ФункцииПравить

Рибосомы, органеллы, катализирующие белковый синтез, состоят у эукариот из малой 40S субъединицы и большой 60S субъединицы, названных так по их коэффициентам седиментации. В сумме две субъединицы включают 4 вида РНК и около 80 структурных белков. Белок RPS28 является компонентом малой 40S субъединицы. Белок локализуется в цитоплазме клетки и принадлежит к семейству рибосомальных белков S28E. Существуют многочисленные псевдогены гена RPS28, распределённые в геноме, что характерно для генов рибосомальных белков^[7].

СтруктураПравить

RPS28 состоит из 69 аминокислот, молекулярная масса 6,8 кДа. В малой 40S субъединице рибосомы взаимодействует с 5 отдельными белками.

ПатологияПравить

Мутации белка RPS28 могут приводить к анемии Даймонда-Блекфена 15-го типа, наследственному заболеванию системы крови, при котором нарушается формирование эритроцитов. как правило, проявляется в раннем детстве. Характеризуется от умеренной до сильной макроцитарной анемией, эритробластопенией и повышенным риском развития новообразований. В 30-40% случаев анемия Даймонда-Блекфена приводит также к низкому росту, наследственным физическим деформациям, в первую очередь недоразвитие верхней челюсти, синдром Робена, аномалии развития большого пальца и мочеполовой системы.

См. такжеПравить

ЛитератураПравить

Wool I. G., Chan Y. L., Glück A. Structure and evolution of mammalian ribosomal proteins. (англ.) // Biochem. Cell Biol. (англ.) (рус. : journal. — 1996. — Vol. 73, no. 11—12. — P. 933—947. — doi:10.1139/o95-101. — PMID 8722009.
Vladimirov S. N., Ivanov A. V., Karpova G. G., etal. Characterization of the human small-ribosomal-subunit proteins by N-terminal and internal sequencing, and mass spectrometry (англ.) // Eur. J. Biochem. (англ.) (рус. : journal. — 1996. — Vol. 239, no. 1. — P. 144—149. — doi:10.1111/j.1432-1033.1996.0144u.x. — PMID 8706699.
Yoshihama M., Uechi T., Asakawa S., etal. The human ribosomal protein genes: sequencing and comparative analysis of 73 genes (англ.) // Genome Res. (англ.) (рус. : journal. — 2002. — Vol. 12, no. 3. — P. 379—390. — doi:10.1101/gr.214202. — PMID 11875025.
Strausberg R. L., Feingold E. A., Grouse L. H., etal. Generation and initial analysis of more than 15,000 full-length human and mouse cDNA sequences (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 2003. — Vol. 99, no. 26. — P. 16899—16903. — doi:10.1073/pnas.242603899. — PMID 12477932.
Gerhard D. S., Wagner L., Feingold E. A., etal. The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC) (англ.) // Genome Res. (англ.) (рус. : journal. — 2004. — Vol. 14, no. 10B. — P. 2121—2127. — doi:10.1101/gr.2596504. — PMID 15489334.
Yu Y., Ji H., Doudna J. A., Leary J. A. Mass spectrometric analysis of the human 40S ribosomal subunit: native and HCV IRES-bound complexes (англ.) // Protein Sci. (англ.) (рус. : journal. — 2005. — Vol. 14, no. 6. — P. 1438—1446. — doi:10.1110/ps.041293005. — PMID 15883184.
Stelzl U., Worm U., Lalowski M., etal. A human protein–protein interaction network: a resource for annotating the proteome (англ.) // Cell : journal. — Cell Press, 2005. — Vol. 122, no. 6. — P. 957—968. — doi:10.1016/j.cell.2005.08.029. — PMID 16169070.
Rual J. F., Venkatesan K., Hao T., etal. Towards a proteome-scale map of the human protein–protein interaction network (англ.) // Nature : journal. — 2005. — Vol. 437, no. 7062. — P. 1173—1178. — doi:10.1038/nature04209. — PMID 16189514.
Kimura K., Wakamatsu A., Suzuki Y., etal. Diversification of transcriptional modulation: large-scale identification and characterization of putative alternative promoters of human genes (англ.) // Genome Res. (англ.) (рус. : journal. — 2006. — Vol. 16, no. 1. — P. 55—65. — doi:10.1101/gr.4039406. — PMID 16344560.
Ewing R. M., Chu P., Elisma F., etal. Large-scale mapping of human protein–protein interactions by mass spectrometry (англ.) // Mol. Syst. Biol. (англ.) (рус. : journal. — 2007. — Vol. 3, no. 1. — P. 89. — doi:10.1038/msb4100134. — PMID 17353931.

ПримечанияПравить

↑ ¹ ² ³ GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000233927 - Ensembl, May 2017
↑ ¹ ² ³ GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000067288 - Ensembl, May 2017
↑ Human PubMed Reference: (неопр.) National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
↑ Mouse PubMed Reference: (неопр.) National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
↑ Hori N., Murakawa K., Matoba R., Fukushima A., Okubo K., Matsubara K. A cDNA sequence of human ribosomal protein, homologue of yeast S28 (англ.) // Nucleic Acids Res (англ.) (рус. : journal. — 1993. — November (vol. 21, no. 18). — P. 4394. — doi:10.1093/nar/21.18.4394. — PMID 8415000.
↑ Kenmochi N., Kawaguchi T., Rozen S., Davis E., Goodman N., Hudson T. J., Tanaka T., Page D. C. A map of 75 human ribosomal protein genes (англ.) // Genome Res (англ.) (рус. : journal. — 1998. — August (vol. 8, no. 5). — P. 509—523. — doi:10.1101/gr.8.5.509. — PMID 9582194.
↑ ¹ ² Entrez Gene: RPS28 ribosomal protein S28 (неопр.).

[refGRCh38Ensembl-1] ¹ ² ³ GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000233927 - Ensembl, May 2017

[refGRCm38Ensembl-2] ¹ ² ³ GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000067288 - Ensembl, May 2017

[3] Human PubMed Reference: (неопр.) National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.

[4] Mouse PubMed Reference: (неопр.) National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.

[pmid8415000-5] Hori N., Murakawa K., Matoba R., Fukushima A., Okubo K., Matsubara K. A cDNA sequence of human ribosomal protein, homologue of yeast S28 (англ.) // Nucleic Acids Res (англ.) (рус. : journal. — 1993. — November (vol. 21, no. 18). — P. 4394. — doi:10.1093/nar/21.18.4394. — PMID 8415000.

[pmid9582194-6] Kenmochi N., Kawaguchi T., Rozen S., Davis E., Goodman N., Hudson T. J., Tanaka T., Page D. C. A map of 75 human ribosomal protein genes (англ.) // Genome Res (англ.) (рус. : journal. — 1998. — August (vol. 8, no. 5). — P. 509—523. — doi:10.1101/gr.8.5.509. — PMID 9582194.

[entrez-7] ¹ ² Entrez Gene: RPS28 ribosomal protein S28 (неопр.).

[5]

[6]

[7]

[1]

[2]

[3]

[4]