Фрагменты Оказаки

Фрагменты Оказаки (англ. Okazaki fragments) — относительно короткие фрагменты ДНК (с РНК-праймером на 5'-конце), которые образуются на отстающей цепи в процессе репликации ДНК. Длина фрагментов Оказаки у E. coli составляет около 1000—2000 нуклеотидов, а у эукариот — обычно 100—200 нуклеотидов.

Фрагменты Оказаки были описаны в 1968 году Рэйдзи Окадзаки, Цунеко Окадзаки и их соавторами при изучении репликации ДНК бактериофага у кишечной палочки^[1]^[2].

МеханизмПравить

Схема репликации ДНК

Каждый фрагмент Оказаки образуется рядом с репликационной вилкой после РНК-праймера, образуемого праймазой, и далее продолжается ДНК-полимеразой III в случае прокариот. У эукариот отстающая цепь синтезируется ДНК-полимеразой α. Праймер позднее удаляется ферментом с эндонуклеазной активностью, подобной РНКаза H, flap-эндонуклеазе^[en] и геликазе/нуклеазе DNA2L^[en].

ПримечанияПравить

↑ Okazaki R, Okazaki T, Sakabe K, Sugimoto K. Mechanism of DNA replication possible discontinuity of DNA chain growth. Jpn J Med Sci Biol. 1967 Jun;20(3):255-260. PMID 4861623
↑ Ogawa T, Okazaki T, Discontinuous DNA Replication. Annu. Rev. Biochem. 49:421-457, 1980. doi:10.1146/annurev.bi.49.070180.002225

ЛитератураПравить

Inman RB, Schnos M. Structure of branch points in replicating DNA: Presence of single-stranded connections in lambda DNA branch points. J. Mol Biol. 56:319-325, 1971. doi:10.1016/0022-2836(71)90467-0. PMID 4927949
Thommes P, Hubscher U. Eukaryotic DNA replication. Enzymes and proteins acting at the fork. Eur. J. Biochem. 194(3):699-712, 1990. doi:10.1111/j.1432-1033.1990.tb19460.x. PMID 2269294

[1] Okazaki R, Okazaki T, Sakabe K, Sugimoto K. Mechanism of DNA replication possible discontinuity of DNA chain growth. Jpn J Med Sci Biol. 1967 Jun;20(3):255-260. PMID 4861623

[2] Ogawa T, Okazaki T, Discontinuous DNA Replication. Annu. Rev. Biochem. 49:421-457, 1980. doi:10.1146/annurev.bi.49.070180.002225

[1]

[2]