![]( "английский")
English: Conformation changes of ATP synthase during the rotary cycle of adenosine triphosphate (ATP) synthesis. Piecewise Cubic Hermite Interpolating Polynomial (PCHIP) interpolation is shown between each main state identified by electron microscopy. Major frame: 40.0x22.5 nm
ATP synthase is an enzyme that creates the major energy storage molecule — adenosine triphosphate (ATP), also known as «molecular unit of currency» — that is found in all known forms of life. The formation of ATP is energetically unfavorable and would not normally proceed. In order to drive this reaction forward, ATP synthase couples ATP synthesis to an electrochemical gradient that drives rotational motor mechanism allowing for ATP production. Because of its rotating subunit, ATP synthase is a molecular machine.
Technical details:: System: ATP synthase [CAS 9000-83-3], Adenosine triphosphate [Adenosine 5'-(tetrahydrogen triphosphate), CAS 56-65-5]; Electron microscopy data: Zhou et al. [1], PDB files: 5ARA, 5ARH, 5FIK, 5ARI, 5ARE; EMDataResource: EMD-3169. Coordinates interpolation and extra PDB-files production by Piecewise Cubic Hermite Interpolating Polynomial (PCHIP) was done with self-written script in MathWorks Matlab (R2020a). Data visualisation and animation was done with Molecular Maya (Clarafi mMaya for Autodesk Maya 2018). The video file was created with Adobe Media Encoder (v14.2) from a batch of jpeg-frames — by Theora for Premiere Pro (v0.5b5, 7 March 2014).
References::
[1] Anna Zhou, Alexis Rohou, Daniel G. Schep, John V. Bason, Martin G. Montgomery, John E. Walker, Nikolaus Grigorieff, John L. Rubinstein «
Structure and conformational states of the bovine mitochondrial ATP synthase by cryo-EM» // eLife 2015;4:e10180 DOI: 10.7554/eLife.10180.
![]( "русский")
Русский: Конформационные изменения АТФ-синтазы в ходе вращательного цикла синтеза аденозинтрифосфата (АТФ). Показана интерполяция с использование кусочно-кубических многочленов Эрмита (PCHIP) между каждым из основных состояний, идентифицированных с помощью электронной микроскопии. Размер основного изображения: 40.0 x 22.5 нм
АТФ-синтаза является ферментом, который создает ключевую молекулу для накопления энергии — аденозинтрифосфат (АТФ), также известный как «молекулярная валюта» — встречающийся во всех известных формах жизни («универсальный источник энергии»). Образование АТФ энергетически невыгодно и не происходит при нормальных условиях. Чтобы провести данную реакцию, АТФ-синтаза объединяет синтез АТФ с электрохимическим градиентом — градиент приводит в движение вращательный механизм, позволяющий формировать молекулы АТФ. Из-за своей вращающейся субъединицы АТФ-синтаза является молекулярной машиной.
Технические детали:: Система: АТФ-синтаза [CAS 9000-83-3], Аденозинтрифосфат [9-β-D-рибофуранозиладенин-5'-трифосфат, CAS 56-65-5]; Данные электронной микроскопии: Zhou et al. [1], PDB-файлы: 5ARA, 5ARH, 5FIK, 5ARI, 5ARE; EMDataResource: EMD-3169. Интерполяция координат и создание дополнительных PDB-файлов c использованием кусочно-кубических многочленов Эрмита (PCHIP) были выполнены с помощью собственного скрипта в MathWorks Matlab (R2020a). Визуализация и анимация данных были выполнены с помощью Molecular Maya (Clarafi mMaya для Autodesk Maya 2018). Видеофайл был создан с помощью Adobe Media Encoder (v14.2) из набора jpeg-кадров — при использовании Theora Premiere Pro (v0.5b5, 7 марта 2014).
_22.jpg)
