Проект «Протеом человека»

«Протеом человека» (Human Proteome Project, НРР) — международный проект по созданию протеомной карты, включающей все белки, кодируемые геномом человека. Первоочередной задачей проекта является составление протеомных карт основных белков плазмы крови, печени, головного мозга^[1].

ИсторияПравить

Международный проект «Протеом человека» стартовал в сентябре 2010 года в Сиднее, став продолжением проекта «Геном человека»^[2]. В состав участников проекта «Протеом человека» входят шесть стран-инициаторов: Республика Корея, США, РФ, Швеция, Канада и Иран). По масштабу поставленной проблемы и предполагаемой трудоёмкости работ проект «Протеом человека» оказался значительно более масштабен, чем «Геном человека». В то время, как геном человека состоит из порядка 20 тыс. генов, то количество белков в организме человека за счёт наличия различных белковых протеоформ превышает 2 млн.^[3]. Кроме того, в отличие от генома, протеом непрерывно меняется в зависимости от влияния внутриклеточных и внешних факторов, и по сути представляет собой фиксированную во времени совокупность белков в конкретном биологическом объекте и в определённой ситуации.

МетодыПравить

Среди принятых международным сообществом способов исследования протеома, одним из наиболее успешно развивающихся стал хромосомо- или геноцентричный подход, при котором результаты анализа белков картируются на соответствующие им белок-кодирующие гены. Формализация научной задачи за счёт геноцентричного подхода делает её осуществление намного более реалистичной по сравнению с альтернативными подходами (тотальное белковое типирование), позволяя сконцентрировать усилия на белках, кодируемых генами определённой хромосомы, и тем самым разбить проект на отдельные подпроекты — по числу пар хромосом в геноме человека^[4].

См. такжеПравить

ПримечанияПравить

↑ Дедов, И. И., Тюльпаков, А. Н., Чехонин, В. П., Баклаушев, В. П., Арчаков, А. И., & Мошковский, С. А. Персонализированная медицина: современное состояние и перспективы // Вестник Российской академии медицинских наук. — 2012. — Т. 67, № 12. — С. 4-12. — ISSN 0869-6047. — doi:10.15690/vramn.v67i12.474.
↑ Legrain P., Aebersold R., Archakov A., Bairoch A., Bala K., Beretta L., Bergeron J., Borchers C.H., Corthals G.L., Costello C.E. et al. The human proteome project: current state and future direction // Molecular & cellular proteomics. — 2011. — Т. 10, № 7. — С. M111. 009993. — doi:10.1074/mcp.M111.009993.
↑ Archakov A., Zgoda V., Kopylov A., Naryzhny S., Chernobrovkin A., Ponomarenko E., Lisitsa A. Chromosome-centric approach to overcoming bottlenecks in the Human Proteome Project // Expert review of proteomics. — 2012. — Т. 9, № 6. — С. 667-676. — doi:10.1021/pr300821n.
↑ Пономаренко, Е. А., Згода, В. Г., Копылов, А. Т., Поверенная, Е. В., Ильгисонис, Е. В., Лисица, А. В., & Арчаков, А. И. Россия в международном проекте “протеом человека”: первые итоги и перспективы // Биомедицинская химия. — 2015. — Т. 61, № 2. — С. 169-175. — doi:10.18097/PBMC20156102169.

ЛитератураПравить

Дорожная карта «Протеом 18-ой хромосомы человека: геноцентричный подход к идентификации транскриптов, белков и пептидов». Рабочая группа по международному Проекту «Протеом человека» Российское протеомное общество (RHUPO), 2010.

[1] Дедов, И. И., Тюльпаков, А. Н., Чехонин, В. П., Баклаушев, В. П., Арчаков, А. И., & Мошковский, С. А. Персонализированная медицина: современное состояние и перспективы // Вестник Российской академии медицинских наук. — 2012. — Т. 67, № 12. — С. 4-12. — ISSN 0869-6047. — doi:10.15690/vramn.v67i12.474.

[2] Legrain P., Aebersold R., Archakov A., Bairoch A., Bala K., Beretta L., Bergeron J., Borchers C.H., Corthals G.L., Costello C.E. et al. The human proteome project: current state and future direction // Molecular & cellular proteomics. — 2011. — Т. 10, № 7. — С. M111. 009993. — doi:10.1074/mcp.M111.009993.

[3] Archakov A., Zgoda V., Kopylov A., Naryzhny S., Chernobrovkin A., Ponomarenko E., Lisitsa A. Chromosome-centric approach to overcoming bottlenecks in the Human Proteome Project // Expert review of proteomics. — 2012. — Т. 9, № 6. — С. 667-676. — doi:10.1021/pr300821n.

[4] Пономаренко, Е. А., Згода, В. Г., Копылов, А. Т., Поверенная, Е. В., Ильгисонис, Е. В., Лисица, А. В., & Арчаков, А. И. Россия в международном проекте “протеом человека”: первые итоги и перспективы // Биомедицинская химия. — 2015. — Т. 61, № 2. — С. 169-175. — doi:10.18097/PBMC20156102169.

[1]

[2]

[3]

[4]