Малацидины

Малацидины
Малацидины
Общие
Хим. формула	C56H88N12O20
Физические свойства
Молярная масса	1249,38 г/моль
Классификация
SMILES	CC(NC([C@@H]1C[C@@H](CN1C([C@H](NC([C@@H](NC(CNC([C@H](NC([C@H](NC([C@H](NC([C@@H](N2)C(C)C)=O)CCCCN)=O)C(C(O)=O)O)=O)CC(O)=O)=O)=O)C(C)C(O)=O)=O)C(C)C)=O)C)=O)[C@@H](NC([C@H](NC(/C=C/C=C\CCC(C)C)=O)C(C)C(O)=O)=O)C2=O
	Приведены данные для стандартных условий (25 °C, 100 кПа), если не указано иное.

Малацидины (англ. Malacidin) — класс химических соединений биологического происхождения, вторичные метаболиты почвенных бактерий, способные поражать грамположительные бактерии. Активность малацидинов является кальций-зависимой. Открытие нового класса антибиотиков было опубликовано в 2018 году.^[1]

Малацидины были обнаружены с помощью нового метода скрининга почвенного микробиома, который позволяет обнаружение биосинтетических генных кластеров, необходимых для синтеза химического вещества в клетке. Малацидин A способен убивать Staphylococcus aureus и другие грамположительные бактерии.

ИсторияПравить

Малацидины были впервые обнаружены учёными из Рокфеллеровского университета. Группа, возглавлявшаяся Брэдом Ховером и Шоном Брейди, выделили ДНК из двух тысяч образцов почв, собранных в разнообразных местах США, что позволило создать метагеномные библиотеки. Поиск был сфокусирован на поиске биосинтетических генных кластеров, участвующих в синтезе вторичных метаболитов. Одни из таких биосинтетических генных кластеров были представлены в 19 % образцов почв и отсутствовали в культивированных бактериях. Эти генные кластеры были перенесены в бактерии в культуре и полученные вторичные метаболиты исследованы.^[1]^[2]

На 2018 год малацидины не тестировались на людях, подобные испытания очень долгие и дорогостоящие. Неизвестно, приведёт ли открытие к появлению новой группы лекарств. К тому же малацидины работают только на грамположительных бактериях. Однако они убивают даже «супер-штаммы», резистентные к обычным антибиотикам, наподобие метициллинрезистентного золотистого стафилококка.

Химическая структураПравить

Малацидины являются макроциклическими липопептидами. Описано два малацидина A и B, отличающиеся лишь по метиленовой группе в липидной части молекулы.^[1] Пептидное ядро малацидинов содержит четыре непротеиногенных аминокислоты.^[1] Название malacidin является сокращением от metagenomic acidic lipopeptide antibiotic и суффикса -cidin.^[3]

Механизм действияПравить

При связывании с кальцием малацидины переходят в активную форму, которая способна взаимодействовать с липидом II, предшественником компонента бактериальной клеточной стенки. Это взаимодействие приводит к разрушению клеточной стенки бактерии и её гибели.^[1]^[4] Таким образом, малацидины стали новыми членами класса кальций-зависимых антибиотиков.^[1]^[5]

См. такжеПравить

ПримечанияПравить

↑ ¹ ² ³ ⁴ ⁵ ⁶ Hover, Bradley M.; Kim, Seong-Hwan; Katz, Micah; Charlop-Powers, Zachary; Owen, Jeremy G.; Ternei, Melinda A.; Maniko, Jeffrey; Estrela, Andreia B.; Molina, Henrik; Park, Steven; Perlin, David S.; Brady, Sean F. Culture-independent discovery of the malacidins as calcium-dependent antibiotics with activity against multidrug-resistant Gram-positive pathogens (англ.) // Nature Microbiology (англ.) (рус. : journal. — 2018. — 12 February. — doi:10.1038/s41564-018-0110-1. — PMID 29434326.
↑ New antibiotic family discovered in dirt (неопр.). BBC (13 февраля 2018). Дата обращения: 13 февраля 2018. Архивировано 13 февраля 2018 года.
↑ Healy, Melissa In soil-dwelling bacteria, scientists find a new weapon to fight drug-resistant superbugs (неопр.). Los Angeles Times (13 февраля 2018). Дата обращения: 13 февраля 2018. Архивировано 13 февраля 2018 года.
↑ Soil search unearths new class of antibiotics, Chemistry World (14 февраля 2018). Архивировано 9 июля 2018 года. Дата обращения: 19 февраля 2018.
↑ Kaplan, Sarah A potentially powerful new antibiotic is discovered in dirt (неопр.). The Washington Post (13 февраля 2018). Дата обращения: 13 февраля 2018. Архивировано 10 июля 2018 года.

СсылкиПравить

«Новый потенциальный антибиотик нашли в грязи» (неопр.). Чердак/ТАСС. Дата обращения: 17 февраля 2018.
«Учёные синтезировали антибиотик из грязи» (неопр.). Еспресо. Дата обращения: 17 февраля 2018.

[Hover_2018-1] ¹ ² ³ ⁴ ⁵ ⁶ Hover, Bradley M.; Kim, Seong-Hwan; Katz, Micah; Charlop-Powers, Zachary; Owen, Jeremy G.; Ternei, Melinda A.; Maniko, Jeffrey; Estrela, Andreia B.; Molina, Henrik; Park, Steven; Perlin, David S.; Brady, Sean F. Culture-independent discovery of the malacidins as calcium-dependent antibiotics with activity against multidrug-resistant Gram-positive pathogens (англ.) // Nature Microbiology (англ.) (рус. : journal. — 2018. — 12 February. — doi:10.1038/s41564-018-0110-1. — PMID 29434326.

[bbc-2] New antibiotic family discovered in dirt (неопр.). BBC (13 февраля 2018). Дата обращения: 13 февраля 2018. Архивировано 13 февраля 2018 года.

[latimes-3] Healy, Melissa In soil-dwelling bacteria, scientists find a new weapon to fight drug-resistant superbugs (неопр.). Los Angeles Times (13 февраля 2018). Дата обращения: 13 февраля 2018. Архивировано 13 февраля 2018 года.

[4] Soil search unearths new class of antibiotics, Chemistry World (14 февраля 2018). Архивировано 9 июля 2018 года. Дата обращения: 19 февраля 2018.

[wapost-5] Kaplan, Sarah A potentially powerful new antibiotic is discovered in dirt (неопр.). The Washington Post (13 февраля 2018). Дата обращения: 13 февраля 2018. Архивировано 10 июля 2018 года.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

Малацидины

Общие
Хим. формула	C₅₆H₈₈N₁₂O₂₀
Физические свойства
Молярная масса	1249,38 г/моль
Классификация
SMILES	CC(NC([C@@H]1C[C@@H](CN1C([C@H](NC([C@@H](NC(CNC([C@H](NC([C@H](NC([C@H](NC([C@@H](N2)C(C)C)=O)CCCCN)=O)C(C(O)=O)O)=O)CC(O)=O)=O)=O)C(C)C(O)=O)=O)C(C)C)=O)C)=O)[C@@H](NC([C@H](NC(/C=C/C=C\CCC(C)C)=O)C(C)C(O)=O)=O)C2=O
Приведены данные для стандартных условий (25 °C, 100 кПа), если не указано иное.