Корархеоты

Корархеоты
Корархеоты
Научная классификация
	Домен: Археи Тип: Корархеоты
Международное научное название
	Korarchaeota Barns et al. 1996
Синонимы
	Xenarchaeota; Xenarchaea;
ITIS	951424
NCBI	51967
EOL	10556730

Корархеоты^[2] (лат. Korarchaeota) — тип архей^[3].

В каждом из этих камчатских горячих источников были обнаружены корархеоты

Анализ последовательности генов их 16s рРНК показал, что корархеоты давно отделились от остальных архей и не принадлежат к их главным группам, кренархеотам (Crenarchaeota) и эвриархеотам (Euryarchaeota)^[4]. Анализ генома одного из корархеот, выращенного в смешанной культуре, выявил ряд сближающих с кренархеотами и эвриархеотами черт, тем самым подтвердив гипотезу о существовании древнего общего предка этих групп^[5].

ЭкологияПравить

Корархеоты были найдены только в гидротермальных источниках с высокой температурой. У разных особей имеются различия на разном филогенетическом уровне, связанные с условиями, в которых они обитают: температурой, солёностью воды (пресная или морская) и/или географией места^[6]. В природе корархеоты были обнаружены лишь небольших количествах^[6]^[7]^[8].

КлассификацияПравить

На июнь 2017 года в таксон включают всего 1 описанный род и вид^[3], который пока не удалось культивировать в чистой культуре^[2]:

Род Candidatus Korarchaeum Elkins et al. 2008
- Candidatus Korarchaeum cryptofilum Elkins et al. 2008

В окружающей среде найдено несколько геномов, относящихся к типу, но не к указанным выше роду и виду.

ПримечанияПравить

↑ ¹ ² Korarchaeota (англ.) на сайте Национального центра биотехнологической информации (NCBI). (Дата обращения: 28 июля 2017).
↑ ¹ ² Воробьёва Л. И. Археи : учебное пособие для вузов. — М. : ИКЦ «Академкнига», 2007. — С. 361. — 447 с. : ил. — ISBN 978-5-94628-277-2.
↑ ¹ ² Taxonomy Browser : Korarchaeota : [англ.] // NCBI. (Дата обращения: 28 июля 2017).
↑ Barns S. M., Delwiche C. F., Palmer J. D., Pace N. R. Perspectives on archaeal diversity, thermophily and monophyly from environmental rRNA sequences (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 1996. — August (vol. 93, no. 17). — P. 9188—9193. — doi:10.1073/pnas.93.17.9188. — Bibcode: 1996PNAS...93.9188B. — PMID 8799176.
↑ Elkins J. G., Podar M., Graham D. E., Makarova K. S., Wolf Y., Randau L., Hedlund B. P., Brochier-Armanet C., Kunin V., Anderson I., Lapidus A., Goltsman E., Barry K., Koonin E. V., Hugenholtz P., Kyrpides N., Wanner G., Richardson P., Keller M., Stetter K. O. A korarchaeal genome reveals insights into the evolution of the Archaea (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 2008. — July (vol. 105, no. 1). — P. 8805—8806. — doi:10.1073/pnas.0801980105. — Bibcode: 2008PNAS..105.8102E. — PMID 18535141.
↑ ¹ ² Auchtung T. A., Shyndriayeva G., Cavanaugh C. M. 16S rRNA phylogenetic analysis and quantification of Korarchaeota indigenous to the hot springs of Kamchatka, Russia (англ.) // Extremophiles : journal. — 2011. — Vol. 15, no. 1. — P. 105—116. — doi:10.1007/s00792-010-0340-5. — PMID 21153671.
↑ Reigstad L. J., Jorgensen S. L., Schleper C. Diversity and abundance of Korarchaeota in terrestrial hot springs of Iceland and Kamchatka (англ.) // ISME J. (англ.) (рус. : journal. — 2010. — Vol. 4, no. 3. — P. 346—356. — doi:10.1038/ismej.2009.126. — PMID 19956276.
↑ Auchtung Thomas A. (2007). Ecology of the hydrothermal candidate archaeal division, Korarchaeota. PhD thesis, Harvard University.

[NCBI-1] ¹ ² Korarchaeota (англ.) на сайте Национального центра биотехнологической информации (NCBI). (Дата обращения: 28 июля 2017).

[Vorobyova2007-2] ¹ ² Воробьёва Л. И. Археи : учебное пособие для вузов. — М. : ИКЦ «Академкнига», 2007. — С. 361. — 447 с. : ил. — ISBN 978-5-94628-277-2.

[NCBI_tax-3] ¹ ² Taxonomy Browser : Korarchaeota : [англ.] // NCBI. (Дата обращения: 28 июля 2017).

[4] Barns S. M., Delwiche C. F., Palmer J. D., Pace N. R. Perspectives on archaeal diversity, thermophily and monophyly from environmental rRNA sequences (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 1996. — August (vol. 93, no. 17). — P. 9188—9193. — doi:10.1073/pnas.93.17.9188. — Bibcode: 1996PNAS...93.9188B. — PMID 8799176.

[5] Elkins J. G., Podar M., Graham D. E., Makarova K. S., Wolf Y., Randau L., Hedlund B. P., Brochier-Armanet C., Kunin V., Anderson I., Lapidus A., Goltsman E., Barry K., Koonin E. V., Hugenholtz P., Kyrpides N., Wanner G., Richardson P., Keller M., Stetter K. O. A korarchaeal genome reveals insights into the evolution of the Archaea (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 2008. — July (vol. 105, no. 1). — P. 8805—8806. — doi:10.1073/pnas.0801980105. — Bibcode: 2008PNAS..105.8102E. — PMID 18535141.

[KamKors-6] ¹ ² Auchtung T. A., Shyndriayeva G., Cavanaugh C. M. 16S rRNA phylogenetic analysis and quantification of Korarchaeota indigenous to the hot springs of Kamchatka, Russia (англ.) // Extremophiles : journal. — 2011. — Vol. 15, no. 1. — P. 105—116. — doi:10.1007/s00792-010-0340-5. — PMID 21153671.

[7] Reigstad L. J., Jorgensen S. L., Schleper C. Diversity and abundance of Korarchaeota in terrestrial hot springs of Iceland and Kamchatka (англ.) // ISME J. (англ.) (рус. : journal. — 2010. — Vol. 4, no. 3. — P. 346—356. — doi:10.1038/ismej.2009.126. — PMID 19956276.

[8] Auchtung Thomas A. (2007). Ecology of the hydrothermal candidate archaeal division, Korarchaeota. PhD thesis, Harvard University.

[2]

[3]

[1]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]