Коилин

Коилин
Коилин
Идентификаторы
Псевдонимы	COIL, Coil, C79982, Cln80, p80, p80-coilin, coilin
Внешние ID	OMIM: 600272 MGI: 104842 HomoloGene: 3413 GeneCards: COIL
Расположение гена (человек)
Расположение гена (человек)
Хр.	17-я хромосома человека
Конец	56,961,050 bp
Расположение гена (Мышь)
Расположение гена (Мышь)
Хр.	11-я хромосома мыши
Конец	88,882,439 bp
Паттерн экспрессии РНК
Паттерн экспрессии РНК
	Наибольшая экспрессия в
	germinal epithelium; ; parietal pleura; ; visceral pleura; ; secondary oocyte;
	Наибольшая экспрессия в
	seminiferous tubule; ; maxillary prominence; ; primitive streak; ; medial ganglionic eminence;
	Дополнительные справочные данные
	; ;
	Дополнительные справочные данные
Генная онтология
Генная онтология
Молекулярная функция	связывание с белками плазмы; связывание похожих белков; protein C-terminus binding; U1 snRNA binding; U2 snRNA binding;
Компонент клетки	Тельце Кахаля; ядрышко; мембрана; клеточное ядро; нуклеоплазма; fibrillar center; ядерные тельца;
Биологический процесс	spliceosomal snRNP assembly;
	Источники: Amigo, QuickGO
Ортологи
Ортологи
	8161
	12812
	ENSG00000121058
	ENSMUSG00000033983
	P38432
	E9Q284
	NM_004645
	NM_016706
	NP_004636
	NP_057915
	Информация в Викиданных
Смотреть (человек)	Смотреть (мышь)

Коилин — это белок, который у человека кодируется геном COIL^[5]^[6]. Он получил своё название из-за своей свёрнутой в кольцо формы англ. coiled, которую он принимает в тельце Кахаля. Впервые его удалось обнаружить используя человеческую аутоиммунную сыворотку. У этого гена есть псевдогены на хромосомах 4 и 14^[6].

Коилин — один из главных компонентов телец Кахаля (ТК). Это небольшие ядерные органеллы варьирующей численности и состава, которые участвуют в процессинге малых ядерных и малых ядрышковых РНК. В дополнение к своей структурной роли, коилин ведёт себя как клей, присоединяя тельце Кахаля к ядрышко. N-конец коилина отвечает за его само-олигомеризацию, в то время как C-конец влияет на количество и сборку ядерных телец, которое присутствует в клетке. Такие модификации как метилирование и фосфорилирование, вероятно, влияют на локализацию коилина внутри ядерных телец, а также на их состав и процесс сборки телец Кахаля.

Для исследования телец Кахаля, коилин часто сливают с GFP (Зелёный флуоресцентный белок). Полученный гибридный белок коилин-GFP можно использовать для определения местоположения ТК методом флуоресцентной микроскопии. Обычно они располагаются рядом с ядрышком. К другим компонентам, которые входят в состав тельца Кахаля относятся малые ядерные рибонуклеопротеины (мяРНП) и малые ядрышковые РНК (мякРНК).

ВзаимодействияПравить

Коилин взаимодействует со следующими белками:

ПримечанияПравить

↑ ¹ ² ³ GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000121058 - Ensembl, May 2017
↑ ¹ ² ³ GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000033983 - Ensembl, May 2017
↑ Ссылка на публикацию человека на PubMed: (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
↑ Ссылка на публикацию мыши на PubMed: (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
↑ Chan E.K., Takano S., Andrade L.E., Hamel J.C., Matera A.G. Structure, expression and chromosomal localization of human p80-coilin gene (англ.) // Nucleic Acids Res (англ.) (рус. : journal. — 1994. — December (vol. 22, no. 21). — P. 4462—4469. — doi:10.1093/nar/22.21.4462. — PMID 7971277.
↑ ¹ ² Entrez Gene: COIL coilin (неопр.). Архивировано 5 декабря 2010 года.
↑ Hong S., Ka S., Kim S., Park Y., Kang S. p80 coilin, a coiled body-specific protein, interacts with ataxin-1, the SCA1 gene product (англ.) // Biochim. Biophys. Acta (англ.) (рус. : journal. — 2003. — May (vol. 1638, no. 1). — P. 35—42. — doi:10.1016/s0925-4439(03)00038-3. — PMID 12757932.
↑ Hong S., Lee S., Cho S.G., Kang S. UbcH6 interacts with and ubiquitinates the SCA1 gene product ataxin-1 (англ.) // Biochem. Biophys. Res. Commun. (англ.) (рус. : journal. — 2008. — June (vol. 371, no. 2). — P. 256—260. — doi:10.1016/j.bbrc.2008.04.066. — PMID 18439907.
↑ Isaac C., Yang Y., Meier U.T. Nopp140 functions as a molecular link between the nucleolus and the coiled bodies (англ.) // J. Cell Biol. (англ.) (рус. : journal. — 1998. — July (vol. 142, no. 2). — P. 319—329. — doi:10.1083/jcb.142.2.319. — PMID 9679133.
↑ Hebert M.D., Shpargel K.B., Ospina J.K., Tucker K.E., Matera A.G. Coilin methylation regulates nuclear body formation (англ.) // Dev. Cell (англ.) (рус. : journal. — 2002. — September (vol. 3, no. 3). — P. 329—337. — doi:10.1016/s1534-5807(02)00222-8. — PMID 12361597.
↑ ¹ ² Hebert M.D., Szymczyk P.W., Shpargel K.B., Matera A.G. Coilin forms the bridge between Cajal bodies and SMN, the spinal muscular atrophy protein (англ.) // Genes Dev. : journal. — 2001. — October (vol. 15, no. 20). — P. 2720—2729. — doi:10.1101/gad.908401. — PMID 11641277.

Эта статья содержит текст из Национальной библиотеки медицины США, который находится в общественном достоянии.

[refGRCh38Ensembl-1] ¹ ² ³ GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000121058 - Ensembl, May 2017

[refGRCm38Ensembl-2] ¹ ² ³ GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000033983 - Ensembl, May 2017

[3] Ссылка на публикацию человека на PubMed: (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[4] Ссылка на публикацию мыши на PubMed: (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[pmid7971277-5] Chan E.K., Takano S., Andrade L.E., Hamel J.C., Matera A.G. Structure, expression and chromosomal localization of human p80-coilin gene (англ.) // Nucleic Acids Res (англ.) (рус. : journal. — 1994. — December (vol. 22, no. 21). — P. 4462—4469. — doi:10.1093/nar/22.21.4462. — PMID 7971277.

[entrez-6] ¹ ² Entrez Gene: COIL coilin (неопр.). Архивировано 5 декабря 2010 года.

[pmid12757932-7] Hong S., Ka S., Kim S., Park Y., Kang S. p80 coilin, a coiled body-specific protein, interacts with ataxin-1, the SCA1 gene product (англ.) // Biochim. Biophys. Acta (англ.) (рус. : journal. — 2003. — May (vol. 1638, no. 1). — P. 35—42. — doi:10.1016/s0925-4439(03)00038-3. — PMID 12757932.

[pmid18439907-8] Hong S., Lee S., Cho S.G., Kang S. UbcH6 interacts with and ubiquitinates the SCA1 gene product ataxin-1 (англ.) // Biochem. Biophys. Res. Commun. (англ.) (рус. : journal. — 2008. — June (vol. 371, no. 2). — P. 256—260. — doi:10.1016/j.bbrc.2008.04.066. — PMID 18439907.

[pmid9679133-9] Isaac C., Yang Y., Meier U.T. Nopp140 functions as a molecular link between the nucleolus and the coiled bodies (англ.) // J. Cell Biol. (англ.) (рус. : journal. — 1998. — July (vol. 142, no. 2). — P. 319—329. — doi:10.1083/jcb.142.2.319. — PMID 9679133.

[pmid12361597-10] Hebert M.D., Shpargel K.B., Ospina J.K., Tucker K.E., Matera A.G. Coilin methylation regulates nuclear body formation (англ.) // Dev. Cell (англ.) (рус. : journal. — 2002. — September (vol. 3, no. 3). — P. 329—337. — doi:10.1016/s1534-5807(02)00222-8. — PMID 12361597.

[pmid11641277-11] ¹ ² Hebert M.D., Szymczyk P.W., Shpargel K.B., Matera A.G. Coilin forms the bridge between Cajal bodies and SMN, the spinal muscular atrophy protein (англ.) // Genes Dev. : journal. — 2001. — October (vol. 15, no. 20). — P. 2720—2729. — doi:10.1101/gad.908401. — PMID 11641277.

[5]

[6]

[1]

[2]

[3]

[4]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]