Белок синдрома Вискотта — Олдрича

Белок синдрома Вискотта — Олдрича
Белок синдрома Вискотта — Олдрича
Доступные структуры
Доступные структуры
PDB	Поиск ортологов: PDBe RCSB
Список идентификаторов PDB
Список идентификаторов PDB
	1CEE, 1EJ5, 1T84, 2A3Z, 2K42, 2OT0
Идентификаторы
Псевдонимы	WAS, SCNX, THC, THC1, WASPA, WASp, IMD2, Wiskott-Aldrich syndrome, WASP actin nucleation promoting factor
Внешние ID	OMIM: 300392 MGI: 105059 HomoloGene: 30970 GeneCards: WAS
Расположение гена (человек)
Расположение гена (человек)
Хр.	X-хромосома человека
Конец	48,691,427 bp
Расположение гена (Мышь)
Расположение гена (Мышь)
Хр.	X-хромосома мыши
Конец	7,956,737 bp
Паттерн экспрессии РНК
Паттерн экспрессии РНК
	Наибольшая экспрессия в
	Цитоархитектоническое поле Бродмана 10;
	Наибольшая экспрессия в
	subcutaneous adipose tissue; ; ankle joint;
	Дополнительные справочные данные
	; ;
	Дополнительные справочные данные
Генная онтология
Генная онтология
Молекулярная функция	phospholipase binding; GTPase regulator activity; SH3 domain binding; связывание с белками плазмы; связывание похожих белков; actin binding; protein kinase binding; small GTPase binding; actin filament binding;
Компонент клетки	цитоплазма; cell-cell junction; vesicle membrane; actin cytoskeleton; экзосома; Цитоскелет; цитозоль; Микрофиламенты; клеточное ядро; actin cortical patch; site of double-strand break; phagocytic vesicle;
Биологический процесс	defense response; Fc-gamma receptor signaling pathway involved in phagocytosis; actin filament organization; negative regulation of cell motility; cвёртывание крови; positive regulation of Arp2/3 complex-mediated actin nucleation; actin filament-based movement; endosomal transport; actin filament polymerization; regulation of T cell antigen processing and presentation; иммунный ответ; epidermis development; actin polymerization or depolymerization; T cell receptor signaling pathway; T cell activation; regulation of catalytic activity; Rho protein signal transduction; regulation of actin polymerization or depolymerization; regulation of lamellipodium assembly; Cdc42 protein signal transduction; regulation of stress fiber assembly; negative regulation of stress fiber assembly; actin cortical patch assembly; Эндоцитоз; положительная регуляция транскрипции РНК полимеразой II промотор; positive regulation of actin nucleation; actin cortical patch localization; protein-containing complex assembly; cellular response to interferon-gamma; positive regulation of double-strand break repair via homologous recombination; regulation of double-strand break repair via nonhomologous end joining;
	Источники: Amigo, QuickGO
Ортологи
Ортологи
	7454
	22376
	ENSG00000015285
	ENSMUSG00000031165
	P42768
	P70315
	NM_000377
	NM_009515
	NP_000368; NP_000368.1
	NP_033541
	Информация в Викиданных
Смотреть (человек)	Смотреть (мышь)

Белок синдрома Вискотта — Олдрича (англ. The Wiskott–Aldrich Syndrome Protein, WASp) состоит из 502 остатков аминокислот^[5] и имеет сложное доменное строение. Он экспрессируется в гемопоэтических клетках, играет важную роль в реорганизации цитоскелета, сигнальной трансдукции и апоптозе^[6].

Ген WAS, мутации в котором приводят к развитию синдрома Вискотта — Олдрича, локализован на коротком плече Х-хромосомы в области Хp11.4 — Хp11.21. Точнее, ген WAS расположен от В разных источниках по-разному понимают что считается началом гена 48,683,789 до 48,691,426-й пары оснований на Х-хромосоме^[7]. Картирование гена было произведено в 1994 году, было установлено, что ген WAS состоит из 12 экзонов и 11 интронов^[8] общей протяженностью приблизительно 1800 пар нуклеотидов^[9]^[10].

На С-конце белка WASp, в непосредственной близости один от другого, расположены домены связывания мономерного актина и Агр2/3-комплекса. Это обеспечивает пространственное сближение этих молекул и облегчает процесс полимеризации актина. На N-конце и в центральной части белка находятся различные регуляторные домены (WH1, GBD, Роlу-Рrо-участок), обеспечивающие взаимосвязь со множеством специальных белковых молекул и фосфолипидов мембран. Таким образом, белок WASp может служить посредником при взаимодействии различных специфических факторов с мембранными структурами и участвовать в процессе полимеризации актина^[11]^[12].

Возникновение мутации в гене, ответственном за синтез белка WASp, приводит к появлению дефектной формы белка или к полному его отсутствию, что влечёт за собой развитие нарушений иммунитета и гемостаза. Известно не менее 350 мутаций^[7] в гене WAS, ответственных за развитие Х-сцепленного синдрома Вискотта — Олдрича. Основное их количество приходится на нуклеотидные замены (миссенс-/нонсенс-мутации), мутации сплайсинга и малые делеции. Выявляются так же малые инсерции и большие делеции^[13].

У больных с миссенс-мутациями, как правило, наблюдается лёгкое течение заболевания, проявляющееся преимущественно тромбоцитопенией. Для пациентов с различными делециями, вставками нуклеотидов, нонсенс-мутациями и мутациями сайтов сплайсинга характерны более тяжёлые клинические проявления^[14]^[15].

ПримечанияПравить

↑ ¹ ² ³ GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000015285 - Ensembl, May 2017
↑ ¹ ² ³ GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000031165 - Ensembl, May 2017
↑ Ссылка на публикацию человека на PubMed: (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
↑ Ссылка на публикацию мыши на PubMed: (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
↑ P42768[1-502], Wiskott-Aldrich syndrome protein, Homo sapiens
↑ Синдром Вискотта-Олдрича. Резюме (рус.) (pdf). orpha.net (2013). Дата обращения: 7 января 2017. Архивировано 7 января 2017 года.
↑ ¹ ² A service of the U.S. National Library of Medicine: Genetics Home Reference (неопр.). Дата обращения: 4 августа 2013. Архивировано 4 июля 2013 года.
↑ WAS — Wiskott-Aldrich syndrome (eczema-thrombocytopenia) Архивировано 1 февраля 2014 года., Resource of Asian Primary Immunodeficiency Diseases (RAPID)
↑ Derry J. M., Ochs H. D., Francke U. Isolation of a novel gene mutated in Wiskott-Aldrich syndrome. (англ.) // Cell. — 1994. — Vol. 78, no. 4. — P. 635—644. — PMID 8069912.
↑ chrX:48542185-48549817 7,633 bp. UCSC Genome Browser on Human Feb. 2009 (GRCh37/hg19) Assembly
↑ Гусев Н. Б. Движение немышечных клеток и реорганизация актиновых микрофиламентов // Соросовский образовательный журнал. — 2001. — Т. 7, № 7. — С. 9—16.
↑ Thrasher A. J., Burns S. Wiskott-Aldrich syndrome: a disorder of haematopoietic cytoskeletal regulation. (англ.) // Microscopy research and technique. — 1999. — Vol. 47, no. 2. — P. 107—113. — doi:10.1002/(SICI)1097-0029(19991015)47:2<107::AID-JEMT3>3.0.CO;2-H. — PMID 10523789.
↑ База данных: HGMD — Human Gene Mutation Database.
↑ Lemahieu V., Gastier J. M., Francke U. Novel mutations in the Wiskott-Aldrich syndrome protein gene and their effects on transcriptional, translational, and clinical phenotypes. (англ.) // Human mutation. — 1999. — Vol. 14, no. 1. — P. 54—66. — doi:10.1002/(SICI)1098-1004(1999)14:1<54::AID-HUMU7>3.0.CO;2-E. — PMID 10447259.
↑ Lutskiy M. I., Rosen F. S., Remold-O'Donnell E. Genotype-proteotype linkage in the Wiskott-Aldrich syndrome. (англ.) // Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950). — 2005. — Vol. 175, no. 2. — P. 1329—1336. — PMID 16002738.

СсылкиПравить

Сермягина И. Г., Забненкова В. В., Кондратенко И. В., Поляков А. В., ДНК-диагностика синдрома Вискотта-Олдрича // Медицинская генетика, 2009 г., т. 8, N6(84), с. 34—39 (недоступная ссылка)

[refGRCh38Ensembl-1] ¹ ² ³ GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000015285 - Ensembl, May 2017

[refGRCm38Ensembl-2] ¹ ² ³ GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000031165 - Ensembl, May 2017

[3] Ссылка на публикацию человека на PubMed: (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[4] Ссылка на публикацию мыши на PubMed: (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[5] P42768[1-502], Wiskott-Aldrich syndrome protein, Homo sapiens

[orpha.net906-6] Синдром Вискотта-Олдрича. Резюме (рус.) (pdf). orpha.net (2013). Дата обращения: 7 января 2017. Архивировано 7 января 2017 года.

[ghr.nlm.nih.gov-gene-WAS-7] ¹ ² A service of the U.S. National Library of Medicine: Genetics Home Reference (неопр.). Дата обращения: 4 августа 2013. Архивировано 4 июля 2013 года.

[8] WAS — Wiskott-Aldrich syndrome (eczema-thrombocytopenia) Архивировано 1 февраля 2014 года., Resource of Asian Primary Immunodeficiency Diseases (RAPID)

[9] Derry J. M., Ochs H. D., Francke U. Isolation of a novel gene mutated in Wiskott-Aldrich syndrome. (англ.) // Cell. — 1994. — Vol. 78, no. 4. — P. 635—644. — PMID 8069912.

[10] rX:48542185-48549817 7,633 bp. UCSC Genome Browser on Human Feb. 2009 (GRCh37/hg19) Assembly

[11] Гусев Н. Б. Движение немышечных клеток и реорганизация актиновых микрофиламентов // Соросовский образовательный журнал. — 2001. — Т. 7, № 7. — С. 9—16.

[12] Thrasher A. J., Burns S. Wiskott-Aldrich syndrome: a disorder of haematopoietic cytoskeletal regulation. (англ.) // Microscopy research and technique. — 1999. — Vol. 47, no. 2. — P. 107—113. — doi:10.1002/(SICI)1097-0029(19991015)47:2<107::AID-JEMT3>3.0.CO;2-H. — PMID 10523789.

[13] База данных: HGMD — Human Gene Mutation Database.

[14] Lemahieu V., Gastier J. M., Francke U. Novel mutations in the Wiskott-Aldrich syndrome protein gene and their effects on transcriptional, translational, and clinical phenotypes. (англ.) // Human mutation. — 1999. — Vol. 14, no. 1. — P. 54—66. — doi:10.1002/(SICI)1098-1004(1999)14:1<54::AID-HUMU7>3.0.CO;2-E. — PMID 10447259.

[15] Lutskiy M. I., Rosen F. S., Remold-O'Donnell E. Genotype-proteotype linkage in the Wiskott-Aldrich syndrome. (англ.) // Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950). — 2005. — Vol. 175, no. 2. — P. 1329—1336. — PMID 16002738.

[5]

[6]

[1]

[2]

[3]

[4]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]

[13]

[14]

[15]