Бета-сэндвич

β-сэндвич домены состоят из 80-350 аминокислот и обычно встречаются в белках. Они характеризуются двумя противопоставленными антипараллельными β-листами^[1]. Количество нитей, обнаруживаемых в таких доменах, может отличаться от одного белка к другому. β-сэндвич-домены встречаются во множестве типов различных укладок.

Иллюстрация бета-сэндвича на примере тенасцина C (PDB: 1TEN).

Укладка иммуноглобулинового типа, обнаруженная в антителах (Ig-складка), состоит из сэндвич-структуры двух групп антипараллельных β-цепей (7 и 9 шт.), расположенных в двух β-листах с мотивом «греческий ключ»^[2]. Мотив «греческий ключ» также встречается в транстиретине человека.

Мотив «желейный рулет», являющийся развитием мотива «греческий ключ», обнаруживается в углеводсвязывающих белках, таких как конканавалин А и различных лектинах, в коллаген- связывающем домене Staphylococcus aureus Adhesin и в модулях, связывающих фибронектин, как в тенасцине (третий повтор фибронектина типа III). Лектиновый домен L-типа представляет собой разновидность мотива «желейный рулет». Домен C2 в его типичной версии (PKC-C2) представляет собой β-сэндвич, состоящий из 8 β-цепей.

См. такжеПравить

ПримечанияПравить

↑ Kister, A. E. (2006). “Strict rules determine arrangements of strands in sandwich proteins”. PNAS. 103 (11): 4107—4110. DOI:10.1073/pnas.0510747103. PMID 16537492.
↑ Bokhove, Marcel & Jovine, Luca (2018-01-01), Chapter Thirteen - Structure of Zona Pellucida Module Proteins, Current Topics in Developmental Biology Т. 130: 413–442, DOI 10.1016/bs.ctdb.2018.02.007

[Kister-1] Kister, A. E. (2006). “Strict rules determine arrangements of strands in sandwich proteins”. PNAS. 103 (11): 4107—4110. DOI:10.1073/pnas.0510747103. PMID 16537492.

[2] Bokhove, Marcel & Jovine, Luca (2018-01-01), Chapter Thirteen - Structure of Zona Pellucida Module Proteins, Current Topics in Developmental Biology Т. 130: 413–442, DOI 10.1016/bs.ctdb.2018.02.007

[1]

[2]